RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489048.1

NEB-215, Transcript of nebulin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEB, Length 2,738 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEB-215ENST00000489048 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.35□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 LINC00477Q96M19 166 aa8.35□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.35□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.35□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 KALRNO60229 2985 aa8.34□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.34□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.34□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.34□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.34□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 G3V318 75 aa8.34□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 H3BMG7 143 aa8.34□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.34□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 C16orf92Q96LL3 132 aa8.34□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 C20orf173Q96LM9 149 aa8.34□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.34□□□□□ -1.07
NEB-215ENST00000489048 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 CIDEAO60543 219 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 AZU1P20160 251 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 GAGE13Q4V321 117 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 BAALCQ8WXS3 180 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 FAM223BA6NKX1 122 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 SOCS3O14543 225 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 OVOL1O14753 267 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 ATP5G2Q06055 141 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 CDSNQ15517 529 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.33□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 LINC01548A6NM66 108 aa8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 CCL21O00585 134 aa8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 PPP1R17O96001 155 aa8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 GPHB5Q86YW7 130 aa8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 RAXQ9Y2V3 346 aa8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 COX6B1P14854 86 aa8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 SAA4P35542 130 aa8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 ASIPP42127 132 aa8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 NXPH4O95158 308 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 LINC01549A6NIU2 74 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 A6NJY4 79 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 IGF1P05019 195 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 UBE2D1P51668 147 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 ETDBQ3ZM63 59 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 AKAP13Q12802 2813 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 CACNA1AO00555 2505 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 AMTNQ6UX39 209 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.31□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 ACACAQ13085 2346 aa8.3□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 NDUFA4O00483 81 aa8.3□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 NPFFO15130 113 aa8.3□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.3□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.3□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.3□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 BRI3O95415 125 aa8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 KLK15Q9H2R5 256 aa8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 A0A087WW49 117 aa8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 ZNF815PA8K554 130 aa8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 CRYGDP07320 174 aa8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 AGRNO00468 2067 aa8.29□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 ARL3P36405 182 aa8.28□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.28□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.28□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 NDUFS8O00217 210 aa8.28□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 LINC00315P59091 139 aa8.28□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 UBE2D3P61077 147 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms