RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		11.76	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	MUC4	Q99102	2169 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	RYR2	Q92736	4967 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	SNURFL	B1AK76	121 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	HTN1	P15515	57 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	SMIM12	Q96EX1	92 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		11.75	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	SPINK4	O60575	86 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	CRIP1	P50238	77 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	TCTA	P57738	103 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF415	Q09FC8	603 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		11.74	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		11.73	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.73	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	TMEM250	H0YL14	139 aa		11.73	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	TYMS	P04818	313 aa		11.73	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	DAD1	P61803	113 aa		11.73	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	MUC21	Q5SSG8	566 aa		11.73	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM210B	Q96KR6	192 aa		11.73	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		11.73	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	RYR3	Q15413	4870 aa		11.72	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		11.72	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		11.72	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		11.72	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		11.72	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		11.72	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	FAM210A	Q96ND0	272 aa		11.72	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	SPX	Q9BT56	116 aa		11.72	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	DERL1	Q9BUN8	251 aa		11.72	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		11.71	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		11.71	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	IGLV2-8	P01709	118 aa		11.71	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	LINC01559	Q495D7	138 aa		11.71	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		11.71	□□□□□ -0.53
HCLS1-208	ENST00000487290	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		11.7	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	SH2D1A	O60880	128 aa		11.7	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	CXCL1	P09341	107 aa		11.7	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290		Q6ZTI0	123 aa		11.7	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF575	Q86XF7	245 aa		11.7	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	BAGE2	Q86Y30	109 aa		11.7	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	RASL10A	Q92737	203 aa		11.7	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	PTH2	Q96A98	100 aa		11.7	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	C9orf85	Q96MD7	179 aa		11.7	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		11.7	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	NAGK	Q9UJ70	344 aa		11.7	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290		C9JCJ5	164 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	ATP5G1	P05496	136 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	CENPW	Q5EE01	88 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	NACA	E9PAV3	2078 aa		11.69	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	GNRH2	O43555	120 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFB130B	P0DP73	79 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	DEFB130A	P0DP74	79 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	MED9	Q9NWA0	146 aa		11.68	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	KMT2A	Q03164	3969 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	TOR2A	Q5JU69	321 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	APLN	Q9ULZ1	77 aa		11.67	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	GAGE12B	A1L429	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290		M0R2P5	195 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	GAGE7	O76087	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	GAGE12F	P0CL80	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	GAGE12G	P0CL81	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	GAGE12I	P0CL82	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	GNG4	P50150	75 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	PARL	Q9H300	379 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	IL36B	Q9NZH7	164 aa		11.66	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290		B4DEV8	164 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		11.65	□□□□□ -0.54
HCLS1-208	ENST00000487290	LCE6A	A0A183	80 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290	RAB19	A4D1S5	217 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290	MED14OS	P0DP75	135 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290	BIN3	Q9NQY0	253 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		11.64	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290	IGLL5	B9A064	214 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290		H3BNG1	76 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290	ORM1	P02763	201 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290	HOXA5	P20719	270 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290	ASIP	P42127	132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290	IFITM2	Q01629	132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
HCLS1-208	ENST00000487290	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		11.62	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.6 ms