RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 C2orf66Q6UXQ4 117 aa10.54□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 M0R2P5 195 aa10.54□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 SDHAF1A6NFY7 115 aa10.53□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 FAM231DQ6ZW35 169 aa10.53□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 CDH23Q9H251 3354 aa10.53□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 Q8NA96 180 aa10.53□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 C17orf77Q96MU5 243 aa10.53□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 MEGF9Q9H1U4 602 aa10.53□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 CST9LQ9H4G1 147 aa10.53□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 A0A087X0K7 114 aa10.53□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa10.53□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 F6UB75 175 aa10.53□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 HLA-DMBP28068 263 aa10.53□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 A8MWV9 139 aa10.52□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 PSCAO43653 123 aa10.52□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa10.52□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 C11orf52Q96A22 123 aa10.52□□□□□ -0.72
HDLBP-241ENST00000487169 EPG5Q9HCE0 2579 aa10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 Q0VG73 95 aa10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 DEFB136Q30KP8 78 aa10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 MPV17L2Q567V2 206 aa10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 YPEL4Q96NS1 127 aa10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 EML5Q05BV3 1969 aa10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 MSMPQ1L6U9 139 aa10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 STPG4Q8N801 248 aa10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 V9GYV3 84 aa10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 CHD9Q3L8U1 2897 aa10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 AZU1P20160 251 aa10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 C10orf105Q8TEF2 133 aa10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa10.51□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 TIMM21Q9BVV7 248 aa10.51□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 H3BUA1 57 aa10.51□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 IGKV1-17P01599 117 aa10.51□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 ZNRF2Q8NHG8 242 aa10.51□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 SS18Q15532 418 aa10.51□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 SLAQ13239 276 aa10.5□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 ASPHD1Q5U4P2 390 aa10.5□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 ATP6V0BQ99437 205 aa10.5□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.5□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 DSCAML1Q8TD84 2053 aa10.5□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 C10orf126Q8N4M7 172 aa10.5□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.5□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 SAMD5Q5TGI4 173 aa10.5□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 GATD1Q8NB37 220 aa10.5□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 CCL24O00175 119 aa10.49□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa10.49□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 K7EIM0 57 aa10.49□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10.48□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa10.48□□□□□ -0.73
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HDLBP-241ENST00000487169 IGLV1-47P01700 117 aa10.48□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.48□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 DYNAPQ8N1N2 210 aa10.48□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 NEGR1Q7Z3B1 354 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 RITA1Q96K30 269 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 APOC4P55056 127 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 Q8N9W7 124 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 ESDP10768 282 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 Q8N8P6 123 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 AJUBAQ96IF1 538 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 I3L3M4 83 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 ATXN8Q156A1 80 aa10.47□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 NCKAP5O14513 1909 aa10.46□□□□□ -0.73
HDLBP-241ENST00000487169 CTSGP08311 255 aa10.46□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 SMIM2Q9BVW6 85 aa10.46□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 NPYP01303 97 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 I3L2K1 104 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 FOXE3Q13461 319 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 VWC2Q2TAL6 325 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 NPBQ8NG41 125 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 VWC2LB2RUY7 222 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM243Q9BU79 118 aa10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 PMVKQ15126 192 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 FOXI2Q6ZQN5 318 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 GNRH2O43555 120 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 SLURP1P55000 103 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 GAGE6Q13070 117 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 Q8N7P7 452 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 HLA-DRB4P13762 266 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 LENEPQ9Y5L5 61 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa10.44□□□□□ -0.74
HDLBP-241ENST00000487169 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa10.43□□□□□ -0.74
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