RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 M0R3E3 92 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 IGLC6P0CF74 106 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 CKS2P33552 79 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 MUC21Q5SSG8 566 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 C8orf49Q96NF6 230 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 AP1S3Q96PC3 154 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 ATRQ13535 2644 aa7.36□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM89A2RUT3 159 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 FAM223BA6NKX1 122 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF138P52744 262 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 TWIST1Q15672 202 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 C15orf32Q32M92 178 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 AMN1Q8IY45 258 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 ASCL2Q99929 193 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF702PQ9H963 129 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 H3BRM9 83 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 IGHG4P01861 327 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 CLEC3BP05452 202 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 HLA-DRB4P13762 266 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 USMG5Q96IX5 58 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC140Q96MF4 163 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 SMPXQ9UHP9 88 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 S4R3C0 116 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa7.35□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 A0A096LNJ9 63 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM213A2RRL7 107 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 C7orf71A4D174 169 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 K7ERU9 68 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 ATP5LO75964 103 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 FGF6P10767 208 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 RBX1P62877 108 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 ATP5G2Q06055 141 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 RNF152Q8N8N0 203 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 KLK15Q9H2R5 256 aa7.34□□□□□ -1.23
POLR1A-208ENST00000486964 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 OR2T8A6NH00 312 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV3-23P01764 117 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 TRGV3P03979 118 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 PSMB8P28062 276 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 PCP4P48539 62 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 CACNG7P62955 275 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 PRR31Q5SQ13 230 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 C9orf118A6NHY6 69 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 CBY3A6NI87 242 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 LY6G6DO95868 133 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 NCR2O95944 276 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 NPYP01303 97 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 ORM1P02763 201 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 FCER1GP30273 86 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 ESM1Q9NQ30 184 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 HIGD1BQ9P298 99 aa7.32□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 METTL26Q96S19 204 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 SMR3AQ99954 134 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 CST9LQ9H4G1 147 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 U3KQE9 123 aa7.31□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0G2JLM5 398 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 GAGE10A6NGK3 116 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 PRSS47A8MTI9 375 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 ELANEP08246 267 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 FOXE3Q13461 319 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 COTL1Q14019 142 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR1A-208ENST00000486964 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms