RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 TDRG1Q3Y452 100 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 OCC1Q8TAD7 63 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 SPXQ9BT56 116 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 MLST8Q9BVC4 326 aa7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 A8MWL6 223 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 SH2D1AO60880 128 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 MUC21Q5SSG8 566 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 LINC01551Q86U37 167 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 SYT8Q8NBV8 401 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.09□□□□□ -1.27
CTPS1-210ENST00000486889 NOTCH1P46531 2555 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1W2PPQ1 181 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 LYRM9A8MSI8 78 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 F2Z2F3 143 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 M0R036 132 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 CXCL1P09341 107 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 SVBPQ8N300 66 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 SFRP2Q96HF1 295 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 NDUFAF3Q9BU61 184 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 OSTCQ9NRP0 149 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 U3KQK5 164 aa7.08□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 CXorf65A6NEN9 183 aa7.07□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 SNAPINO95295 136 aa7.07□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 EMP1P54849 157 aa7.07□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 CT83Q5H943 113 aa7.07□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.07□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.07□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.07□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 AGRNO00468 2067 aa7.07□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 FAM231BA6NCW3 169 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 C9JQL5 133 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 EREGO14944 169 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 MED14OSP0DP75 135 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 S100PP25815 95 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 KIR3DS1Q14943 382 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 PRR9Q5T870 116 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 ISOC2Q96AB3 205 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 NUDT11Q96G61 164 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.06□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 C19orf71A6NCJ1 209 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 M0R2P5 195 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 CIDEAO60543 219 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 IGLV2-8P01709 118 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 TYMSP04818 313 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 TCL1AP56279 114 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 CACNG7P62955 275 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 RHEBQ15382 184 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 DNLZQ5SXM8 178 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 ZFP82Q8N141 532 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 BTF3L4Q96K17 158 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 TPPP3Q9BW30 176 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 IL36BQ9NZH7 164 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 X6R8D5 127 aa7.05□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 K7EN84 100 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 APOC3P02656 99 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 S100A8P05109 93 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 SMIM17P0DL12 118 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 CRIP1P50238 77 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 DAD1P61803 113 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 Q8NAQ8 132 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 TSKUQ8WUA8 353 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 RETNQ9HD89 108 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CTPS1-210ENST00000486889 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.03□□□□□ -1.28
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