RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-240ENST00000484412 TENM2Q9NT68 2774 aa9.85□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 GCGP01275 180 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM183AQ8IXX5 376 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 SGK494Q96LW2 274 aa9.84□□□□□ -0.83
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV34A0A0B4J273 112 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 CIDEAO60543 219 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 DEFB130BP0DP73 79 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 DEFB130AP0DP74 79 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 CRIP1P50238 77 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF415Q09FC8 603 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF575Q86XF7 245 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 SMIM12Q96EX1 92 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 C8orf49Q96NF6 230 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 MDFICQ9P1T7 246 aa9.83□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 GNRH2O43555 120 aa9.82□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 PDE6DO43924 150 aa9.82□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 UBE2G1P62253 170 aa9.82□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 SLAQ13239 276 aa9.82□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.82□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.81□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 IFNA1P01562 189 aa9.81□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 TYMSP04818 313 aa9.81□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 AKR1C3P42330 323 aa9.81□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 Q6ZTI0 123 aa9.81□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 Q86TA4 180 aa9.81□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 VAX2Q9UIW0 290 aa9.81□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 M0R2P5 195 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 RNF212Q495C1 297 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 MUC21Q5SSG8 566 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 C9orf85Q96MD7 179 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 GNG13Q9P2W3 67 aa9.8□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 GAGE12BA1L429 117 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 GAGE7O76087 117 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 CXCL1P09341 107 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 GAGE12FP0CL80 117 aa9.79□□□□□ -0.84
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HDLBP-240ENST00000484412 GAGE12IP0CL82 117 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 P0DMU3 169 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 FAM231AP0DMU4 169 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 FAM231CP0DMU5 169 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 BCL2P10415 239 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 BAGE2Q86Y30 109 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.79□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 F5H768 121 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 LINC01559Q495D7 138 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 TEX261Q6UWH6 196 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 IL36BQ9NZH7 164 aa9.78□□□□□ -0.84
HDLBP-240ENST00000484412 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 A0A1B0GV50 99 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM250H0YL14 139 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 HOXA5P20719 270 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 RPL35P42766 123 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.77□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 IGLV2-8P01709 118 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 FHL2Q14192 279 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 PRO0255Q9UI72 69 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 LYSTQ99698 3801 aa9.76□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 RBFOX3A6NFN3 312 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 SH2D1AO60880 128 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 LY6G6CO95867 125 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 MED14OSP0DP75 135 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.75□□□□□ -0.85
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HDLBP-240ENST00000484412 MUC4Q99102 2169 aa9.75□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 RS1O15537 224 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 ORM1P02763 201 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 VSIG2Q96IQ7 327 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 MED9Q9NWA0 146 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 NAGKQ9UJ70 344 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 HHLA3Q9XRX5 114 aa9.74□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 B4DEV8 164 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 C9JCJ5 164 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 HTN3P15516 51 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 CRYBA4P53673 196 aa9.73□□□□□ -0.85
HDLBP-240ENST00000484412 OR5I1Q13606 314 aa9.73□□□□□ -0.85
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