RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PATE2Q6UY27 113 aa13.06□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa13.06□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TIMM21Q9BVV7 248 aa13.06□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa13.06□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUPR1O60356 82 aa13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM86BQ8N661 226 aa13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LY6G5BQ8NDX9 201 aa13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFA4O00483 81 aa13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 E7EUB6 86 aa13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GATD1Q8NB37 220 aa13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRPP02741 224 aa13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXE3Q13461 319 aa13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C6orf226Q5I0X4 101 aa13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE12JA6NER3 117 aa13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV2-14P01704 120 aa13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE1Q13065 139 aa13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE4Q13068 117 aa13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE5Q13069 117 aa13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GATA3P23771 443 aa13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8N8P6 123 aa13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV4-59P01825 116 aa13.03□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LTAP01374 205 aa13.03□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.03□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPSP0C0P6 89 aa13.03□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRP4O75096 1905 aa13.03□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TANC2Q9HCD6 1990 aa13.03□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 K7EIM0 57 aa13.02□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDKN1BP46527 198 aa13.02□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZPA2 131 aa13.02□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa13.02□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BLCAPP62952 87 aa13.02□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPINK8P0C7L1 97 aa13.02□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZVH6 145 aa13.02□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DKK2Q9UBU2 259 aa13.02□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FN1P02751 2386 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JPT2Q9H910 190 aa13.01□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GNRH2O43555 120 aa13.01□□□□□ -0.33
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 S100A7L2Q5SY68 101 aa13.01□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCNTO95613 3336 aa13.01□□□□□ -0.33
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa13.01□□□□□ -0.33
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UTF1Q5T230 341 aa13□□□□□ -0.33
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PROP1O75360 226 aa13□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PYGO2Q9BRQ0 406 aa13□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KMT2EQ8IZD2 1858 aa13□□□□□ -0.33
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC01619G3V211 115 aa12.99□□□□□ -0.33
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE7O76087 117 aa12.99□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE12FP0CL80 117 aa12.99□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE12GP0CL81 117 aa12.99□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAGE12IP0CL82 117 aa12.99□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNRF2Q8NHG8 242 aa12.99□□□□□ -0.33
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9JAW5 83 aa12.99□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa12.99□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GP9P14770 177 aa12.99□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EDA2RQ9HAV5 297 aa12.99□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C8orf31Q8N9H6 132 aa12.98□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFHR4Q92496 578 aa12.98□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPANXA1Q9NS26 97 aa12.98□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PMVKQ15126 192 aa12.98□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa12.98□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa12.98□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa12.98□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ETDBQ3ZM63 59 aa12.98□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00173Q6ZV60 143 aa12.98□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CST9LQ9H4G1 147 aa12.98□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTSGP08311 255 aa12.97□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COX8AP10176 69 aa12.97□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUP210LQ5VU65 1888 aa12.97□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRB1P04280 392 aa12.97□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DEFB121Q5J5C9 76 aa12.97□□□□□ -0.33
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