RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 GPX1P07203 203 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 CDKN1BP46527 198 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 CEBPGP53567 150 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 FMC1Q96HJ9 113 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 IGLV2-11P01706 119 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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GARNL3-217ENST00000481875 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 C11orf52Q96A22 123 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 RAB19A4D1S5 217 aa8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM250H0YL14 139 aa8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 INSP01308 110 aa8.18□□□□□ -1.1
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GARNL3-217ENST00000481875 CRISP2P16562 243 aa8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 TAS2R60P59551 318 aa8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 KIR3DS1Q14943 382 aa8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.18□□□□□ -1.1
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GARNL3-217ENST00000481875 BAGE2Q86Y30 109 aa8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 TVP23CQ96ET8 276 aa8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM208Q9BTX3 173 aa8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 DERL1Q9BUN8 251 aa8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.18□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa8.17□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.17□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 C7orf71A4D174 169 aa8.17□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
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GARNL3-217ENST00000481875 LINC01587Q99440 93 aa8.17□□□□□ -1.1
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GARNL3-217ENST00000481875 CENPWQ5EE01 88 aa8.16□□□□□ -1.1
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GARNL3-217ENST00000481875 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.16□□□□□ -1.1
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GARNL3-217ENST00000481875 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.15□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.15□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.15□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 C20orf144Q9BQM9 153 aa8.15□□□□□ -1.1
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 LYRM9A8MSI8 78 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 M0R2N4 97 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 HTN1P15515 57 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 PRR9Q5T870 116 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.14□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 H7BYZ3 331 aa8.13□□□□□ -1.11
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GARNL3-217ENST00000481875 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 Q6AWC8 147 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 UQCC3Q6UW78 93 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 NAGKQ9UJ70 344 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 HSPG2P98160 4391 aa8.13□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 C9JCJ5 164 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 DAD1P61803 113 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 MUC21Q5SSG8 566 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 PRR27Q6MZM9 219 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.12□□□□□ -1.11
GARNL3-217ENST00000481875 Q6ZQT7 251 aa8.12□□□□□ -1.11
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