RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 GCSHP23434 173 aa4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 DEFB1P60022 68 aa4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 ERVFC1-1P60608 527 aa4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 GNG5P63218 68 aa4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 ADIRFQ15847 76 aa4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 GLMPQ8WWB7 406 aa4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM70Q9BUB7 260 aa4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.94□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 TRBV19A0A075B6N1 114 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 A0A087WTM6 91 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 PGPA6NDG6 321 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 C9JCJ5 164 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 SLC17A3O00476 420 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 PEX7O00628 323 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 EREGO14944 169 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 OXTP01178 125 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 PRM2P04554 102 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 ESRGQ1W209 222 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 RRN3P1Q2M238 152 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 C16orf54Q6UWD8 224 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 LINC01551Q86U37 167 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 OCC1Q8TAD7 63 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 ISOC2Q96AB3 205 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 LINC00479Q96M42 142 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 METTL26Q96S19 204 aa4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 A0A087WWC5 75 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 TRAV34A0A0B4J273 112 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 COLCA2A8K830 154 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 B4DEV8 164 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 BUB3O43684 328 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 IGKV3-20P01619 116 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 IGLV2-8P01709 118 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 DEFB130BP0DP73 79 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 DEFB130AP0DP74 79 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 RPL7P18124 248 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 CENPWQ5EE01 88 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 OR8I2Q8N0Y5 310 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 C5orf17Q8NAS9 161 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 YPEL4Q96NS1 127 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 OTORQ9NRC9 128 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 EPDR1Q9UM22 224 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 RPH3ALQ9UNE2 315 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.92□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 CBY3A6NI87 242 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 K7EN84 100 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 ISLRO14498 428 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 TCRAP04437 139 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 ATP5G1P05496 136 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 GNG4P50150 75 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 CNN1P51911 297 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM183BQ1AE95 376 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 S100A7AQ86SG5 101 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 C15orf54Q8N8G6 183 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 NHLRC2Q8NBF2 726 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 HIST1H2BAQ96A08 127 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 SGK494Q96LW2 274 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 NRN1Q9NPD7 142 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 RNF24Q9Y225 148 aa4.91□□□□□ -1.62
CASQ1-203ENST00000481081 A0A087X0K7 114 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 M0R3E3 92 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 IGLV2-11P01706 119 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 MT-ND4LP03901 98 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 CXCL1P09341 107 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 TSPOP30536 169 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 S100A7P31151 101 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 TAS2R60P59551 318 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 PSG9Q00887 426 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 OR5I1Q13606 314 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 PDE6HQ13956 83 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 ELOBQ15370 118 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 IGFL4Q6B9Z1 124 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 FOXI2Q6ZQN5 318 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 KLF12Q9Y4X4 402 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 LY96Q9Y6Y9 160 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.9□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms