RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TRGV2A0A075B6R0 118 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GV50 99 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 PAGE4O60829 102 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 GCGP01275 180 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 CST9LP1Q5W188 147 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 TYMSP04818 313 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 PPT1P50897 306 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 SMUG1Q53HV7 270 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 SPXQ9BT56 116 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-211ENST00000480301 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GVG6 124 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 NUDT3O95989 172 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 SLC51BQ86UW2 128 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 KCNS1Q96KK3 526 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 TCEAL7Q9BRU2 100 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 RAB5CP51148 216 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 RNF212Q495C1 297 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 ZFP69Q49AA0 526 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 Q86TA4 180 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 A0A0J9YY99 117 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 RASL10AQ92737 203 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 MUC4Q99102 2169 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 SULT1A2P50226 295 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 CCL20P78556 96 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 FMC1Q96HJ9 113 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-53P01767 116 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 ZFP30Q9Y2G7 519 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 DNAH10Q8IVF4 4471 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 H3BNG1 76 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 UBE2G1P62253 170 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-211ENST00000480301 FABP5P3A8MUU1 101 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 M0R2P5 195 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 CRIP1P50238 77 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 LTAP01374 205 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 AKR1C3P42330 323 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 FHL2Q14192 279 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 SCO2A0A1W2PP80 73 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 ZNF479Q96JC4 524 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 SFTA3P0C7M3 94 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 C9orf85Q96MD7 179 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 MANBALQ9NQG1 85 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 GNG13Q9P2W3 67 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 NACAE9PAV3 2078 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 CCL18P55774 89 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 PRO0255Q9UI72 69 aa14.54□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 A0A096LPF7 62 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 TRAV4A0A0B4J268 109 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 TEX46H3BTG2 121 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 PAX4O43316 350 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 SH2D1AO60880 128 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 S100A9P06702 114 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 CRYBA4P53673 196 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 SLAQ13239 276 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 ZNF674Q2M3X9 581 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.53□□□□□ -0.08
ACTB-211ENST00000480301 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 M0R2N4 97 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 ZNF876PQ49A33 203 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 OR4C5Q8NGB2 326 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.52□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 C9JCJ5 164 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 ORM1P02763 201 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 ESRGQ1W209 222 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZR54 194 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 ZNF575Q86XF7 245 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 PTH2Q96A98 100 aa14.51□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 DNAH2Q9P225 4427 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 B4DEV8 164 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 BAGE2Q86Y30 109 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 C11orf52Q96A22 123 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 TXNDC17Q9BRA2 123 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 MLST8Q9BVC4 326 aa14.5□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 RS1O15537 224 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 ASIPP42127 132 aa14.49□□□□□ -0.09
ACTB-211ENST00000480301 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.49□□□□□ -0.09
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