RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 UBE2E1P51965 193 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 LAGE3Q14657 143 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 GAS8-AS1O95177 125 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 SMIM17P0DL12 118 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 HLA-DRB4P13762 266 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 STHQ8IWL8 128 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 C16orf92Q96LL3 132 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 PIEZO1Q92508 2521 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 ATP5G2Q06055 141 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 CDIP1Q9H305 208 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 ABCA4P78363 2273 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 F5H768 121 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 TSPAN13O95857 204 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 TRGV3P03979 118 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 MRAP2Q96G30 205 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 CCDC140Q96MF4 163 aa6.67□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 PLNP26678 52 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 SAA4P35542 130 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 RIPPLY3P57055 190 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 KLRB1Q12918 225 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 NRACQ8N912 160 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 A0A087WX48 190 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 G3V318 75 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 FXYD2P54710 66 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 TAL2Q16559 108 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 G3V4G9 280 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 CKS1BP61024 79 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 CDSNQ15517 529 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 NEGR1Q7Z3B1 354 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 CEND1Q8N111 149 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 TM2D2Q9BX73 214 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 U3KQE9 123 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.65□□□□□ -1.34
PKP4-210ENST00000480171 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.65□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 H3BVH4 76 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 NPFFO15130 113 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 LINC00477Q96M19 166 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 FAM223BA6NKX1 122 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 H7C1H1 209 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 EFNA4P52798 201 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 BAALCQ8WXS3 180 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 AJUBAQ96IF1 538 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 WNK2Q9Y3S1 2297 aa6.64□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 K7EMI3 77 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 OVOL1O14753 267 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 FHL3Q13643 280 aa6.63□□□□□ -1.35
PKP4-210ENST00000480171 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.63□□□□□ -1.35
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