RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, human

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF479	Q96JC4	524 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	OR2D2	Q9H210	308 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A1W2PPV4	95 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	OR4C46	A6NHA9	309 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	C2orf70	A6NJV1	201 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423		M0R2Z0	102 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	APOA2	P02652	100 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	COX8A	P10176	69 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	FABP2	P12104	132 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	OPRK1	P41145	380 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	TCL1A	P56279	114 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	MUC21	Q5SSG8	566 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	CCDC140	Q96MF4	163 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	DERL1	Q9BUN8	251 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423		V9GYV3	84 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SZRD1-208	ENST00000476423	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A0G2JLM5	398 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	TMEM213	A2RRL7	107 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	FAM231B	A6NCW3	169 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	LINC00473	A8K010	186 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	GNG7	O60262	68 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	STAG3L2	P0CL84	134 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	SRI	P30626	198 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	CRYBA4	P53673	196 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	TNXA	Q16473	311 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	TIGIT	Q495A1	244 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423		Q5VSD8	79 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	OCC1	Q8TAD7	63 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	BLNK	Q8WV28	456 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	RNF5	Q99942	180 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	SLC25A22	Q9H936	323 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	CACNG5	Q9UF02	275 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A1W2PPM0	123 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	FNDC10	F2Z333	226 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423		K7EQM0	130 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	MYOD1	P15172	320 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	MFAP2	P55001	183 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	ARL16	Q0P5N6	197 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	SLA	Q13239	276 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	DEFB135	Q30KP9	77 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	C15orf32	Q32M92	178 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423		Q56UQ5	140 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	PEMT	Q9UBM1	199 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	FAM223B	A6NKX1	122 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	TEX22	C9J3V5	150 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423		E7EUB6	86 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	CT45A10	P0DMU9	189 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423		Q6ZR54	194 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	USMG5	Q96IX5	58 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423		J3KRW8	73 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SZRD1-208	ENST00000476423	LEPROTL1	O95214	131 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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