RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 FUT9Q9Y231 359 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 MPDU1O75352 247 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 SCO1O75880 301 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 S100A7P31151 101 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 LEPP41159 167 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 CRYBA4P53673 196 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 TCL1AP56279 114 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 GUK1Q16774 197 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 C8orf49Q96NF6 230 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 APOC3P02656 99 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 CRISP2P16562 243 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 FGF7P21781 194 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 PEA15Q15121 130 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 TREM1Q9NP99 234 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 PAX4O43316 350 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 MBP02144 154 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 SFTA3P0C7M3 94 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 RAB2AP61019 212 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 ZNF479Q96JC4 524 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 F8W036 122 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 ZNF253O75346 499 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 SRP19P09132 144 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 ICAM4Q14773 271 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 KHDC3LQ587J8 217 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 SVBPQ8N300 66 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 Q8TAT8 98 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 SFT2D1Q8WV19 159 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 K7EQD1 137 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 ERVFC1-1P60608 527 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 BLNKQ8WV28 456 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 LINC00477Q96M19 166 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 ZNF492Q9P255 531 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 PRO0255Q9UI72 69 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-206ENST00000474188 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 PPT1P50897 306 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 RAB24Q969Q5 203 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 FXYD5Q96DB9 178 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 KCNIP2Q9NS61 270 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 A0A1B0GV50 99 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 FAM74A7A6NL05 159 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 SNAPINO95295 136 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 BCL2P10415 239 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 GCSHP23434 173 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 WFDC2Q14508 124 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 MUC21Q5SSG8 566 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 S100A7AQ86SG5 101 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 GPX1P07203 203 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 STAG3L2P0CL84 134 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 STAG3L3P0CL85 134 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NISCH-206ENST00000474188 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.25□□□□□ -1.25
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