RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, human

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PREB-208	ENST00000468045	TSPAN13	O95857	204 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	HERV-K104	P63124	156 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PREB-208	ENST00000468045	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045		F8VRH5	84 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	PLN	P26678	52 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	EMP1	P54849	157 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045		A6NJY4	79 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045		H7C1H1	209 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	CARD19	Q96LW7	228 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	RAX	Q9Y2V3	346 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045		H3BVH4	76 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	ZNF815P	A8K554	130 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	SLC25A16	P16260	332 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	13.68	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	DEFB124	Q8NES8	71 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	IGF1	P05019	195 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	KIR2DL4	Q99706	377 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045		Q6ZUT4	128 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	DEFB123	Q8N688	67 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045		M0R381	172 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	ERG28	Q9UKR5	140 aa		13.66	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	RNF5	Q99942	180 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	DPM3	Q9P2X0	92 aa		13.65	□□□□□ -0.22
PREB-208	ENST00000468045	PRR9	Q5T870	116 aa		13.65	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		13.65	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	DEFB1	P60022	68 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	RASL10A	Q92737	203 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	BAALC	Q8WXS3	180 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	CLEC3B	P05452	202 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	TCL1B	O95988	128 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	NPB	Q8NG41	125 aa		13.63	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	BUB3	O43684	328 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045		Q6ZS92	163 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	UBE2D1	P51668	147 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	C15orf32	Q32M92	178 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045		Q6ZS46	218 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	GAGE5	Q13069	117 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	GAGE6	Q13070	117 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	TOMM6	Q96B49	74 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	MGP	P08493	103 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	ECSCR	Q19T08	205 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	CD7	P09564	240 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	NBAS	A2RRP1	2371 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	COX6B1	P14854	86 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	UBE2D3	P61077	147 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	UBE2D2	P62837	147 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PREB-208	ENST00000468045	LINC01619	G3V211	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	C11orf86	A6NJI1	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	TEN1	Q86WV5	123 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	RNF223	E7ERA6	249 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	CRYGD	P07320	174 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	LINC01560	Q8TB33	94 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24

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