RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 PAXXQ9BUH6 204 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa9.28□□□□□ -0.92
C9orf3-210ENST00000462125 DNAH2Q9P225 4427 aa9.28□□□□□ -0.92
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C9orf3-210ENST00000462125 F5H768 121 aa9.27□□□□□ -0.93
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C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZR54 194 aa9.27□□□□□ -0.93
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C9orf3-210ENST00000462125 SDF2L1Q9HCN8 221 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 ZNF492Q9P255 531 aa9.27□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 KIAA1109Q2LD37 5005 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1W2PRE2 83 aa9.26□□□□□ -0.93
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C9orf3-210ENST00000462125 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 C11orf52Q96A22 123 aa9.26□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 VGLL1Q99990 258 aa9.26□□□□□ -0.93
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C9orf3-210ENST00000462125 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.26□□□□□ -0.93
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C9orf3-210ENST00000462125 UBE2G2P60604 165 aa9.25□□□□□ -0.93
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C9orf3-210ENST00000462125 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.25□□□□□ -0.93
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C9orf3-210ENST00000462125 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.25□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 RBAKDNA6NC62 111 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 SNURFLB1AK76 121 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 M0R2N4 97 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 PPP1R2P9O14990 202 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 RTL8CO15255 209 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 GPX1P07203 203 aa9.24□□□□□ -0.93
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C9orf3-210ENST00000462125 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.24□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 C18orf15Q96N68 181 aa9.24□□□□□ -0.93
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C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZTI0 123 aa9.22□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa9.22□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.22□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 LENEPQ9Y5L5 61 aa9.22□□□□□ -0.93
C9orf3-210ENST00000462125 COLCA2A8K830 154 aa9.21□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 DIRC3C9JPN6 131 aa9.21□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 CCL18P55774 89 aa9.21□□□□□ -0.94
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C9orf3-210ENST00000462125 OR5I1Q13606 314 aa9.21□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZQT7 251 aa9.21□□□□□ -0.94
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C9orf3-210ENST00000462125 ATG101Q9BSB4 218 aa9.21□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 NACAE9PAV3 2078 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 SPINK4O60575 86 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 S100PP25815 95 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 AKR1C3P42330 323 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 TCL1AP56279 114 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 OTORQ9NRC9 128 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 KLF12Q9Y4X4 402 aa9.2□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.19□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 PGPA6NDG6 321 aa9.19□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.19□□□□□ -0.94
C9orf3-210ENST00000462125 RAB5BP61020 215 aa9.19□□□□□ -0.94
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