RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 TMEM218A2RU14 115 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 ZNF727A8MUV8 499 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 F8W036 122 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 CT45A10P0DMU9 189 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 HTN3P15516 51 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 KIR3DS1Q14943 382 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 DKK2Q9UBU2 259 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.26□□□□□ -1.09
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PRAME-210ENST00000442481 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 PRNTQ86SH4 94 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 Q86TA4 180 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.26□□□□□ -1.09
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PRAME-210ENST00000442481 VGLL1Q99990 258 aa8.26□□□□□ -1.09
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PRAME-210ENST00000442481 RBAKDNA6NC62 111 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 AZU1P20160 251 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R60P59551 318 aa8.25□□□□□ -1.09
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PRAME-210ENST00000442481 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 CENPWQ5EE01 88 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 FMC1Q96HJ9 113 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 PSG8Q9UQ74 426 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 H7BYZ3 331 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 ATP6V1G1O75348 118 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 IGLV2-11P01706 119 aa8.24□□□□□ -1.09
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PRAME-210ENST00000442481 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.24□□□□□ -1.09
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PRAME-210ENST00000442481 LINC00477Q96M19 166 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.23□□□□□ -1.09
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PRAME-210ENST00000442481 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.23□□□□□ -1.09
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PRAME-210ENST00000442481 SEC11CQ9BY50 192 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 NAT8Q9UHE5 227 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 C7orf71A4D174 169 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 C9JCJ5 164 aa8.22□□□□□ -1.09
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PRAME-210ENST00000442481 C8orf49Q96NF6 230 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 ZNF492Q9P255 531 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-210ENST00000442481 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 CBY3A6NI87 242 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 LYRM9A8MSI8 78 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 SNURFLB1AK76 121 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 APOC3P02656 99 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 ADIRFQ15847 76 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 Q8N1X5 172 aa8.21□□□□□ -1.1
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PRAME-210ENST00000442481 NACAE9PAV3 2078 aa8.21□□□□□ -1.1
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PRAME-210ENST00000442481 IGLV2-8P01709 118 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 TNP2Q05952 138 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 PRR9Q5T870 116 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 PRR27Q6MZM9 219 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-210ENST00000442481 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
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