RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CCBE1-202ENST00000439986 DTX1Q86Y01 620 aa9.28□□□□□ -0.92
CCBE1-202ENST00000439986 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.28□□□□□ -0.92
CCBE1-202ENST00000439986 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.28□□□□□ -0.92
CCBE1-202ENST00000439986 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.28□□□□□ -0.92
CCBE1-202ENST00000439986 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.28□□□□□ -0.92
CCBE1-202ENST00000439986 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.28□□□□□ -0.92
CCBE1-202ENST00000439986 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.28□□□□□ -0.92
CCBE1-202ENST00000439986 IGLC1P0CG04 106 aa9.28□□□□□ -0.92
CCBE1-202ENST00000439986 IGLC2P0DOY2 106 aa9.28□□□□□ -0.92
CCBE1-202ENST00000439986 IGLC3P0DOY3 106 aa9.28□□□□□ -0.92
CCBE1-202ENST00000439986 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.27□□□□□ -0.92
CCBE1-202ENST00000439986 C8orf49Q96NF6 230 aa9.27□□□□□ -0.92
CCBE1-202ENST00000439986 BPESC1Q9GZL8 116 aa9.27□□□□□ -0.92
CCBE1-202ENST00000439986 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.27□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM158Q8WZ71 300 aa9.27□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 A0A0B4J2C4 111 aa9.27□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 GAFA1Q96PS6 74 aa9.27□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.27□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa9.27□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa9.27□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 XCL2Q9UBD3 114 aa9.27□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.27□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 H0YJW9 148 aa9.27□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 LEPROTO15243 131 aa9.26□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 NDUFC1O43677 76 aa9.26□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 IGKV1-16P04430 117 aa9.26□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 CLPSL2Q6UWE3 100 aa9.26□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 RASL10AQ92737 203 aa9.26□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 RNF114Q9Y508 228 aa9.26□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 WDR86Q86TI4 376 aa9.26□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 RMI2Q96E14 147 aa9.26□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 V9GYV3 84 aa9.26□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.26□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 DEFB131AP59861 70 aa9.26□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 SMPXQ9UHP9 88 aa9.26□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 LMO1P25800 156 aa9.25□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 PSMB8P28062 276 aa9.25□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 DEFB125Q8N687 156 aa9.25□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 FXYD5Q96DB9 178 aa9.25□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 SS18Q15532 418 aa9.25□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 CGB7P0DN87 165 aa9.25□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa9.25□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 B4DSR2 109 aa9.25□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 Q96MF0 132 aa9.25□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 OVOL3O00110 214 aa9.25□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 SAA4P35542 130 aa9.25□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 DSCR9P59020 149 aa9.25□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 hADV29S1A0JD25 119 aa9.24□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 MYO7BQ6PIF6 2116 aa9.24□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.24□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 ABCA1O95477 2261 aa9.24□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 H3BT86 120 aa9.24□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.24□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.24□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 EP400Q96L91 3159 aa9.24□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 HLA-DRB4P13762 266 aa9.24□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.24□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.24□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.24□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 THADAQ6YHU6 1953 aa9.23□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.23□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.23□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 CACNA1HO95180 2353 aa9.23□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.23□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 MDS2Q8NDY4 140 aa9.23□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 TRGV9Q99603 122 aa9.23□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM14BQ9NUH8 114 aa9.23□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 ALPK3Q96L96 1907 aa9.23□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 COX7A2LO14548 114 aa9.23□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 CEND1Q8N111 149 aa9.22□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF134P52741 427 aa9.22□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 NXPH4O95158 308 aa9.22□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 CASC2Q6XLA1 102 aa9.22□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 MT-ATP8P03928 68 aa9.22□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 IGLL1P15814 213 aa9.22□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.22□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.22□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 SLC25A16P16260 332 aa9.21□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 C11orf52Q96A22 123 aa9.21□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 LHBP01229 141 aa9.21□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 DOCK10Q96BY6 2186 aa9.21□□□□□ -0.93
CCBE1-202ENST00000439986 NBASA2RRP1 2371 aa9.21□□□□□ -0.94
CCBE1-202ENST00000439986 NUPR1O60356 82 aa9.21□□□□□ -0.94
CCBE1-202ENST00000439986 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
CCBE1-202ENST00000439986 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.21□□□□□ -0.94
CCBE1-202ENST00000439986 CADP27708 2225 aa9.21□□□□□ -0.94
CCBE1-202ENST00000439986 Q6ZSR3 168 aa9.2□□□□□ -0.94
CCBE1-202ENST00000439986 DAND5Q8N907 189 aa9.2□□□□□ -0.94
CCBE1-202ENST00000439986 FAM223BA6NKX1 122 aa9.2□□□□□ -0.94
CCBE1-202ENST00000439986 FAM223AQ8IWN6 122 aa9.2□□□□□ -0.94
CCBE1-202ENST00000439986 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
CCBE1-202ENST00000439986 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa9.2□□□□□ -0.94
CCBE1-202ENST00000439986 Q6ZR03 302 aa9.2□□□□□ -0.94
CCBE1-202ENST00000439986 U3KQA8 63 aa9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms