RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01619G3V211 115 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL24O00175 119 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 PLNP26678 52 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF815PA8K554 130 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A20O43772 301 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV1-2P23083 117 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 DUX3Q96PT4 197 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01546A6NGU7 62 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 ASIPP42127 132 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZT83 130 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 KLK15Q9H2R5 256 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 LY6DQ14210 128 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8N8P6 123 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 RASL10AQ92737 203 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 F8VRH5 84 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 CD7P09564 240 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8TAT8 98 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 Q96MF0 132 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 H7C1H1 209 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 LAGE3Q14657 143 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 USP24Q9UPU5 2620 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 PLCE1Q9P212 2302 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 K7EM74 188 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLC6P0CF74 106 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 VPREB1P12018 145 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A16P16260 332 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6Q795 121 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8N1Y9 231 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 ODF3Q96PU9 254 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 DTX2Q86UW9 622 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL13Q99616 98 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00574Q9H8X3 128 aa6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 H7C2G1 150 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 CECR9P0C854 216 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR25Q96S07 402 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB127Q9H1M4 99 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 KALRNO60229 2985 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRY3O43610 288 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV2-23P01705 113 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 MDFICQ9P1T7 246 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 MED13Q9UHV7 2174 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 TRGV3P03979 118 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 CFC1BP0CG36 223 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 CFC1P0CG37 223 aa6.46□□□□□ -1.37
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RABGEF1-203ENST00000439720 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.46□□□□□ -1.37
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00694P0DN24 101 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 MSMPQ1L6U9 139 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM126AQ9H061 195 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL3L1P16619 93 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 PLGLAQ15195 96 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF575Q86XF7 245 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01587Q99440 93 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.45□□□□□ -1.38
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