RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 RAB2AP61019 212 aa14.25□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 TVP23CQ96ET8 276 aa14.25□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 KCNS1Q96KK3 526 aa14.25□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.25□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 TYMSP04818 313 aa14.24□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 SH2D6Q7Z4S9 175 aa14.24□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.24□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 OR4C5Q8NGB2 326 aa14.24□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 OR10G9Q8NGN4 311 aa14.24□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 OR10G7Q8NGN6 311 aa14.24□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.24□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.24□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 TREM1Q9NP99 234 aa14.24□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa14.23□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 GNRH2O43555 120 aa14.23□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 EVI2AP22794 236 aa14.23□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 TIRAPP58753 221 aa14.23□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.23□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 F6UZH7 168 aa14.22□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 STAG3L2P0CL84 134 aa14.22□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 STAG3L3P0CL85 134 aa14.22□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 SUN5Q8TC36 379 aa14.22□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 MSRB1Q9NZV6 116 aa14.22□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087WTM6 91 aa14.21□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 ARL14EPLP0DKL9 152 aa14.21□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.21□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 ASB13Q8WXK3 278 aa14.21□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.21□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 ALG5Q9Y673 324 aa14.21□□□□□ -0.13
LIMS1-208ENST00000428064 CIDEAO60543 219 aa14.2□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 GNG5P63218 68 aa14.2□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf17Q8NAS9 161 aa14.2□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 TCRAP04437 139 aa14.19□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 AQP10Q96PS8 301 aa14.19□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.19□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 K7EQM0 130 aa14.18□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 SERF2P84101 59 aa14.18□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 MBP02144 154 aa14.17□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 CRYGDP07320 174 aa14.17□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 RAB24Q969Q5 203 aa14.17□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 PTH2Q96A98 100 aa14.17□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.16□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 TAAR5O14804 337 aa14.16□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 PTTG1O95997 202 aa14.16□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 PFN1P07737 140 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 GCHFRP30047 84 aa14.16□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF876PQ49A33 203 aa14.16□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa14.16□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.15□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.15□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 RS1O15537 224 aa14.15□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV2-11P01706 119 aa14.15□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V0CP27449 155 aa14.15□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 LINC01556Q5JQF7 62 aa14.15□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.15□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.15□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 C9orf85Q96MD7 179 aa14.15□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM167BQ9NRX6 74 aa14.15□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.15□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 PSG8Q9UQ74 426 aa14.15□□□□□ -0.14
LIMS1-208ENST00000428064 GCGP01275 180 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 PPT1P50897 306 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 XGP55808 180 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 RHOHQ15669 191 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 ZFP69Q49AA0 526 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 SGK494Q96LW2 274 aa14.14□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 EPM2AB3EWF7 344 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 GGTLC3B5MD39 225 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 CXorf1O96002 111 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP14.13□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 SMUG1Q53HV7 270 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 MED28Q9H204 178 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 EPDR1Q9UM22 224 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.13□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.12□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 FAT1Q14517 4588 aa14.11□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.11□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa14.11□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa14.11□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PRE2 83 aa14.1□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 KRTAP10-1P60331 282 aa14.1□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.1□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.1□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 SH3BGRL3Q9H299 93 aa14.1□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 LELP1Q5T871 98 aa14.09□□□□□ -0.15
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