RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.04□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.04□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PEX7O00628 323 aa6.04□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CIDEAO60543 219 aa6.04□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.04□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GNG5P63218 68 aa6.04□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.04□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.04□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.04□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAGE12BA1L429 117 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAGE7O76087 117 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGLV2-11P01706 119 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRM2P04554 102 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAGE12FP0CL80 117 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAGE12GP0CL81 117 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAGE12IP0CL82 117 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBE2G1P62253 170 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q6ZTI0 123 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q86TA4 180 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RASL10AQ92737 203 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MANBALQ9NQG1 85 aa6.03□□□□□ -1.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GCGP01275 180 aa6.02□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IFNA1P01562 189 aa6.02□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCL18P55774 89 aa6.02□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBE2G2P60604 165 aa6.02□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.02□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CST9LP1Q5W188 147 aa6.02□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.02□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTH2Q96A98 100 aa6.02□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.01□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.01□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 M0R2P5 195 aa6.01□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AKR1C3P42330 323 aa6.01□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SULT1A2P50226 295 aa6.01□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MUC21Q5SSG8 566 aa6.01□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRNTQ86SH4 94 aa6.01□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TVP23CQ96ET8 276 aa6.01□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRO0255Q9UI72 69 aa6.01□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NAGKQ9UJ70 344 aa6.01□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NACAE9PAV3 2078 aa6□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PAGE4O60829 102 aa6□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LTAP01374 205 aa6□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ORM1P02763 201 aa6□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TYMSP04818 313 aa6□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR5I1Q13606 314 aa6□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMIM12Q96EX1 92 aa6□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MDFICQ9P1T7 246 aa6□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.99□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUDT3O95989 172 aa5.99□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CXCL1P09341 107 aa5.99□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTC32Q5I0X7 151 aa5.99□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.99□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNLZQ5SXM8 178 aa5.99□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.99□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.99□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C11orf52Q96A22 123 aa5.99□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C8orf49Q96NF6 230 aa5.99□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UPK3BQ9BT76 320 aa5.99□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.99□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C9JCJ5 164 aa5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PAX4O43316 350 aa5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PDE6DO43924 150 aa5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HOXA5P20719 270 aa5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ASIPP42127 132 aa5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SGK494Q96LW2 274 aa5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C9orf85Q96MD7 179 aa5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL36BQ9NZH7 164 aa5.98□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.97□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAV34A0A0B4J273 112 aa5.97□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A1W2PPQ1 181 aa5.97□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A8MWV9 139 aa5.97□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 B4DEV8 164 aa5.97□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 K7EP13 123 aa5.97□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MED14OSP0DP75 135 aa5.97□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CRYBA4P53673 196 aa5.97□□□□□ -1.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BLOC1S1P78537 153 aa5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms