RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 CNTFRP26992 372 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 CLEC2BQ92478 149 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 LINC00477Q96M19 166 aa7.39□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 SPRY3O43610 288 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 TRACP01848 142 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 DLX1P56177 255 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 NPC2P61916 151 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 CCL13Q99616 98 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 C11orf86A6NJI1 115 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF883P0CG24 379 aa7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 GUSBP11Q6P575 273 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 SLC25A45Q8N413 288 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 ERCC8Q13216 396 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1B0GX51 115 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 TRIAP1O43715 76 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.37□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 H7C423 109 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 MGPP08493 103 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 COX6B1P14854 86 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 CCL3L1P16619 93 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.36□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 TRANK1O15050 2925 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 METTL26Q96S19 204 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF576Q9H609 170 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 SRRM5B3KS81 715 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 COX7CP15954 63 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 LY6DQ14210 128 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 DSCAMO60469 2012 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 IGHG4P01861 327 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 DLX6P56179 175 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 CACNA1BQ00975 2339 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 NRACQ8N912 160 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 M0R381 172 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 FOLR3P41439 243 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 EBI3Q14213 229 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 CFHR4Q92496 578 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 NACAE9PAV3 2078 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 LINC01546A6NGU7 62 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 OVOL1O14753 267 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 COX6CP09669 75 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 Q6ZSV7 163 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 RNF125Q96EQ8 232 aa7.34□□□□□ -1.23
TMOD1-203ENST00000395211 J3QLI3 93 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 J3QQQ9 107 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 CCL11P51671 97 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 POLEQ07864 2286 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 EPOPA6NHQ4 379 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 IGKV1-17P01599 117 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 IL11RAQ14626 422 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 DPH3Q96FX2 82 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 P0DMU3 169 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 FAM231AP0DMU4 169 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 FAM231CP0DMU5 169 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 CGB3P0DN86 165 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 CGB7P0DN87 165 aa7.33□□□□□ -1.24
TMOD1-203ENST00000395211 CCL4P13236 92 aa7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms