RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-208	ENST00000392449	SPX	Q9BT56	116 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PTPRK-208	ENST00000392449	ALG5	Q9Y673	324 aa		11.27	□□□□□ -0.6
PTPRK-208	ENST00000392449	TYMS	P04818	313 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	TDRG1	Q3Y452	100 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449		Q8N1X5	172 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	TREM1	Q9NP99	234 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		11.26	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		11.25	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449		M0R2P5	195 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		11.24	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	ERVFC1-1	P60608	527 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449		Q5BKY6	102 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		11.23	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449		C9JCJ5	164 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	ORM1	P02763	201 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	STAG3L2	P0CL84	134 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	STAG3L3	P0CL85	134 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	RAB24	Q969Q5	203 aa		11.22	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449		A0A087WTM6	91 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	ATP6V0C	P27449	155 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	GCHFR	P30047	84 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	ASB13	Q8WXK3	278 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		11.21	□□□□□ -0.61
PTPRK-208	ENST00000392449	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	GGTLC3	B5MD39	225 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	TCRA	P04437	139 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		11.2	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	IGLV2-11	P01706	119 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	EVI2A	P22794	236 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	NFE4	Q86UQ8	179 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	AQP10	Q96PS8	301 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	EREG	O14944	169 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	GCG	P01275	180 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	CRYGD	P07320	174 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	KRTAP10-1	P60331	282 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF876P	Q49A33	203 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	PRNT	Q86SH4	94 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	SUN5	Q8TC36	379 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	KCNS1	Q96KK3	526 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	PSG8	Q9UQ74	426 aa		11.19	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	PPT1	P50897	306 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	MED28	Q9H204	178 aa		11.18	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	XG	P55808	180 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	LINC00479	Q96M42	142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	EPDR1	Q9UM22	224 aa		11.17	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	C9orf85	Q96MD7	179 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	FAT1	Q14517	4588 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	TAAR5	O14804	337 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	RS1	O15537	224 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	CXorf1	O96002	111 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PTPRK-208	ENST00000392449	RNF222	A6NCQ9	220 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-208	ENST00000392449		K7EQM0	130 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-208	ENST00000392449	PTTG1	O95997	202 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-208	ENST00000392449	HAMP	P81172	84 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-208	ENST00000392449	SERF2	P84101	59 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-208	ENST00000392449	SMUG1	Q53HV7	270 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-208	ENST00000392449	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-208	ENST00000392449	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PTPRK-208	ENST00000392449	MB	P02144	154 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRK-208	ENST00000392449	UBE2G2	P60604	165 aa		11.13	□□□□□ -0.63
PTPRK-208	ENST00000392449	LCE2C	Q5TA81	110 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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