RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A1W2PPM0 123 aa18.24■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM223BA6NKX1 122 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 PRSS47A8MTI9 375 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 TRGV3P03979 118 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM78Q5T7P6 136 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM223AQ8IWN6 122 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 DPM2O94777 84 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 OR5A1Q8NGJ0 315 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 FOXC2Q99958 501 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 ACACBO00763 2458 aa18.23■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 HIF1ANQ9NWT6 349 aa18.22■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 CSMD2Q7Z408 3487 aa18.21■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa18.21■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 H3BUX3 64 aa18.21■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 SMIM13P0DJ93 91 aa18.21■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 HLA-DRB4P13762 266 aa18.21■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 C8orf86Q6ZUL3 223 aa18.21■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa18.21■□□□□ 0.51
AMIGO1-201ENST00000369862 TRBV12-3P01733 135 aa18.21■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 IGF1P05019 195 aa18.21■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SMIM17P0DL12 118 aa18.21■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP6V0BQ99437 205 aa18.21■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CHAC1Q9BUX1 264 aa18.21■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM8BA6NDV4 472 aa18.2■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SAP30O75446 220 aa18.2■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 MSMBP08118 114 aa18.2■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 NRACQ8N912 160 aa18.2■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SPCS1Q9Y6A9 102 aa18.2■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 GCSHP23434 173 aa18.19■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa18.19■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa18.19■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 A6NDX4 124 aa18.19■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ARL3P36405 182 aa18.19■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 LAGE3Q14657 143 aa18.19■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TM4SF20Q53R12 229 aa18.19■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa18.19■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 NRGNQ92686 78 aa18.19■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 FABP2P12104 132 aa18.18■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 IGHG2P01859 326 aa18.18■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 FXYD2P54710 66 aa18.18■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa18.18■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 Q6ZS46 218 aa18.18■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 GTSCR1Q86UQ5 136 aa18.18■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 MYOZ3Q8TDC0 251 aa18.18■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TTTY13Q9BZ97 58 aa18.18■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 MYO18BQ8IUG5 2567 aa18.18■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa18.17■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 AVPP01185 164 aa18.17■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 BLCAPP62952 87 aa18.17■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SAMD5Q5TGI4 173 aa18.17■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 CSTL1Q9H114 145 aa18.17■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 NEGR1Q7Z3B1 354 aa18.17■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 GLMPQ8WWB7 406 aa18.16■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 UFC1Q9Y3C8 167 aa18.16■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa18.15■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 G3V4G9 280 aa18.15■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SPANXN1Q5VSR9 72 aa18.15■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 KLK15Q9H2R5 256 aa18.15■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM160Q9NX00 188 aa18.15■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
AMIGO1-201ENST00000369862 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP18.14■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 TM2D2Q9BX73 214 aa18.14■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 SELENOKQ9Y6D0 94 aa18.14■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 SPOCK3Q9BQ16 436 aa18.14■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A087WX48 190 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 IGHV3-11P01762 117 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 LCNL1Q6ZST4 164 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CEND1Q8N111 149 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 MRAP2Q96G30 205 aa18.13■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 C16orf92Q96LL3 132 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 C20orf173Q96LM9 149 aa18.12■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 NDUFA4O00483 81 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 BRI3O95415 125 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 GPHB5Q86YW7 130 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 LENEPQ9Y5L5 61 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 B4DSR2 109 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PLNP26678 52 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 Q6ZQT7 251 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 CSPG4Q6UVK1 2322 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 H3BUA1 57 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 USMG5Q96IX5 58 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 PF4V1P10720 104 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 H3BVH4 76 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 TAL2Q16559 108 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 C9orf139Q6ZV77 190 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 USP24Q9UPU5 2620 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 SMIM2Q9BVW6 85 aa18.08■□□□□ 0.49
AMIGO1-201ENST00000369862 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-201ENST00000369862 K7ERJ3 54 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-201ENST00000369862 PRR9Q5T870 116 aa18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-201ENST00000369862 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
AMIGO1-201ENST00000369862 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-201ENST00000369862 IGLV1-40P01703 118 aa18.07■□□□□ 0.48
AMIGO1-201ENST00000369862 PRB1P04280 392 aa18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 175.7 ms