RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 H0YIG0 161 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 RS1O15537 224 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 ATP5LO75964 103 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 IGKCP01834 107 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 CXCL10P02778 98 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 IL4P05112 153 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 COX7CP15954 63 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 PSMB8P28062 276 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 FCER1GP30273 86 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 CAMPP49913 170 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF138P52744 262 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 EFNA4P52798 201 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM258P61165 79 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 Q71RC1 249 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 C8orf31Q8N9H6 132 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 FAM57AQ8TBR7 257 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 SPTSSAQ969W0 71 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 FXYD5Q96DB9 178 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 DPH3Q96FX2 82 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 TIMD4Q96H15 378 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 UPK3BQ9BT76 320 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 CNFNQ9BYD5 112 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 TTTY13Q9BZ97 58 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 PRORYQ9H606 182 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 PRNDQ9UKY0 176 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 FZR1Q9UM11 496 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 EPDR1Q9UM22 224 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 SVILO95425 2214 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV17A0A0B4J275 112 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1B0GUT8 65 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 RBAKDNA6NC62 111 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 OOSP1A8MZH6 123 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 H3BT86 120 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A20O43772 301 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 DPM2O94777 84 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 SCGB1C2P0DMR2 95 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 CD24P25063 80 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 CXCL5P42830 114 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 PLGLB1Q02325 96 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 PMVKQ15126 192 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 OR1C1Q15619 314 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 NNATQ16517 81 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 FAM104BQ5XKR9 115 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 PVRIGQ6DKI7 326 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.53□□□□□ -2
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PTPRC-202ENST00000367364 C10orf126Q8N4M7 172 aa2.53□□□□□ -2
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PTPRC-202ENST00000367364 THAP8Q8NA92 274 aa2.53□□□□□ -2
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PTPRC-202ENST00000367364 FMC1Q96HJ9 113 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 EMC6Q9BV81 110 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM14BQ9NUH8 114 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 DOCK10Q96BY6 2186 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-202ENST00000367364 NAV3Q8IVL0 2385 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 LINC01549A6NIU2 74 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 UPK2O00526 184 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 CHEK1O14757 476 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 PLXNB1O43157 2135 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 CDK2AP2O75956 126 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 ACYP1P07311 99 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 ARMS2P0C7Q2 107 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 SEC61GP60059 68 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 Q86TA4 180 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 ZGRF1Q86YA3 2104 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 MKXQ8IYA7 352 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 SLC25A45Q8N413 288 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 Q8N8P6 123 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 OR8A1Q8NGG7 326 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 SSMEM1Q8WWF3 244 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 PLEKHB2Q96CS7 222 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 PGLYRP4Q96LB8 373 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 ENY2Q9NPA8 101 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 CALYQ9NYX4 217 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 NACAE9PAV3 2078 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV2A0A0B4J234 112 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRC-202ENST00000367364 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa2.51□□□□□ -2.01
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