RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 LYZP61626 148 aa1.9□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 STARD4Q96DR4 205 aa1.9□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 GALNT14Q96FL9 552 aa1.9□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZBP1Q9H171 429 aa1.9□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CA10Q9NS85 328 aa1.9□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TAAR3PQ9P1P4 343 aa1.9□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 R4GMQ9 66 aa1.9□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PLXNB1O43157 2135 aa1.9□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 MCM3APO60318 1980 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 HMGN4O00479 90 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 MGPP08493 103 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 SFTA3P0C7M3 94 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF250P15622 560 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PPICP45877 212 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 NPC2P61916 151 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF117Q03924 483 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 VMA21Q3ZAQ7 101 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 FAM201AQ5SY85 155 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CASC2Q6XLA1 102 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 LINC01551Q86U37 167 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf174Q8IYL3 243 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 OR4D11Q8NGI4 311 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 LINC00052Q96N35 136 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CHD8Q9HCK8 2581 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1B0GXF2 115 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CORTO00230 105 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF737O75373 536 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 NPYP01303 97 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 HLA-DQB1P01920 261 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 IGLV7-43P04211 117 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CD7P09564 240 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PSG2P11465 335 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA0040Q15053 153 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF774Q6NX45 483 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PPDPFLQ8WWR9 84 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TOMM6Q96B49 74 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 NRTNQ99748 197 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 SLC35B3Q9H1N7 401 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM242Q9NWH2 141 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 MTFP1Q9UDX5 166 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CFAP46Q8IYW2 2715 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 SNRPGP15A8MWD9 76 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 SHISA9B4DS77 424 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM250H0YL14 139 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 GNG7O60262 68 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 IGF2P01344 180 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PYYP10082 97 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 UBE2D2P62837 147 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 GNG3P63215 75 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 FOXF1Q12946 379 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 KISS1Q15726 138 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PRR4Q16378 134 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 SCXQ7RTU7 201 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PRIMA1Q86XR5 153 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 C3orf22Q8N5N4 141 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 OR11H7Q8NGC8 314 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 MARVELD1Q9BSK0 173 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 V9GYH0 126 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 A0A087WUJ7 227 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0G2JLM5 398 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 CA11O75493 328 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 SERF1AO75920 110 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 EPPINO95925 133 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 HBDP02042 147 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 OR9G9P0C7N8 305 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 GABRA1P14867 456 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 RND2P52198 227 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 BRD3OSQ6XYD6 125 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 C1QL2Q7Z5L3 287 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 SFXN3Q9BWM7 321 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 C21orf62Q9NYP8 219 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 EPDR1Q9UM22 224 aa1.89□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 PCLOQ9Y6V0 5065 aa1.88□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP1.88□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 C7orf77A4D0Y5 90 aa1.88□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 FXYD1O00168 92 aa1.88□□□□□ -2.11
CCSAP-202ENST00000366686 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131.4 ms