RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341403.9

UBXN8-202, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-202ENST00000341403 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 ODF3BA8MYP8 253 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 IGHV3-30P01768 117 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 CTSGP08311 255 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 COX6CP09669 75 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 CNTFRP26992 372 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 WFDC3Q8IUB2 231 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 METTL26Q96S19 204 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 SDK1Q7Z5N4 2213 aa7.32□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 VCYO14598 125 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 TIMM23O14925 209 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 TCL1BO95988 128 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 INSL3P51460 131 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 FXYD7P58549 80 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 Q8N6K4 173 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 COPS9Q8WXC6 57 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 CARD19Q96LW7 228 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 KIR2DL4Q99706 377 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 U3KQE9 123 aa7.31□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 LEPROTO15243 131 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 BRI3O95415 125 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 CFC1BP0CG36 223 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 CFC1P0CG37 223 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 PRTN3P24158 256 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 LYPD2Q6UXB3 125 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 PRSS33Q8NF86 280 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 Q8TAT8 98 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 RASL10AQ92737 203 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.3□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 M0R2P5 195 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 BSPH1Q075Z2 132 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 ZNF876PQ49A33 203 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 MDFICQ9P1T7 246 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.29□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 A0A0J9YXY3 114 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 IGIPA6NJ69 53 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 H3BMM0 161 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 J3QQQ9 107 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 IGHV3-33P01772 117 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 TRGV3P03979 118 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 EFNA4P52798 201 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 UBE2WQ96B02 151 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 ODF3Q96PU9 254 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.28□□□□□ -1.24
UBXN8-202ENST00000341403 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 FAM223BA6NKX1 122 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 TIMM17BO60830 172 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 DLX1P56177 255 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 FAM27E3Q08E93 113 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 LINC01620Q4KN68 170 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 FAM223AQ8IWN6 122 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 PLCE1Q9P212 2302 aa7.27□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 H3BUA1 57 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 LGALS9O00182 355 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 CD3EP07766 207 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 FHL3Q13643 280 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 LCE2CQ5TA81 110 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 AJUBAQ96IF1 538 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 TMEM101Q96IK0 257 aa7.26□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 PLXNB1O43157 2135 aa7.25□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 C9JAW5 83 aa7.25□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 H3BVH4 76 aa7.25□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 APELAP0DMC3 54 aa7.25□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 COX7A1P24310 79 aa7.25□□□□□ -1.25
UBXN8-202ENST00000341403 ARL3P36405 182 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms