RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 PRSS29PA6NIE9 313 aa15.48■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 RASL10AQ92737 203 aa15.48■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa15.47■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa15.47■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 CD7P09564 240 aa15.47■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 MUC3AQ02505 3323 aa15.47■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa15.47■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 IGF2-ASQ6U949 168 aa15.47■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 SFTA2Q6UW10 78 aa15.47■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 Q8N6K4 173 aa15.47■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 CARD19Q96LW7 228 aa15.47■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 M0R1W7 72 aa15.46■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 C15orf32Q32M92 178 aa15.46■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 PTH2Q96A98 100 aa15.46■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 ERG28Q9UKR5 140 aa15.46■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 CD3EP07766 207 aa15.46■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 DPH3P1Q9H4G8 78 aa15.46■□□□□ 0.07
PPP1CC-201ENST00000335007 NDUFA11Q86Y39 141 aa15.45■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 ASPMQ8IZT6 3477 aa15.45■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa15.45■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa15.45■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 A8MWV9 139 aa15.45■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 SBSPONQ8IVN8 264 aa15.45■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 CLPSL1A2RUU4 121 aa15.44■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 CLEC3BP05452 202 aa15.44■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 HERVK_113P61574 105 aa15.44■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 Q6ZQT7 251 aa15.44■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF318Q5VUA4 2279 aa15.44■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 KALRNO60229 2985 aa15.44■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 M0R381 172 aa15.44■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 TCL1BO95988 128 aa15.44■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF688P0C7X2 276 aa15.44■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 PRTN3P24158 256 aa15.44■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 DCHS1Q96JQ0 3298 aa15.43■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa15.43■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 LENEPQ9Y5L5 61 aa15.43■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 OOSP1A8MZH6 123 aa15.42■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 EBI3Q14213 229 aa15.42■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 METTL26Q96S19 204 aa15.42■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 A0A0J9YY99 117 aa15.42■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa15.42■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa15.41■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa15.41■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM262E9PQX1 116 aa15.41■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 PPP1R17O96001 155 aa15.41■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 PRR9Q5T870 116 aa15.41■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 RNF223E7ERA6 249 aa15.41■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 VMO1Q7Z5L0 202 aa15.41■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 RNF183Q96D59 192 aa15.41■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa15.4■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 MGPP08493 103 aa15.4■□□□□ 0.06
PPP1CC-201ENST00000335007 S100A4P26447 101 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 ECSCRQ19T08 205 aa15.39■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 KLK9Q2XQG4 91 aa15.39■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 ANAPC13Q9BS18 74 aa15.39■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 KLK9Q9UKQ9 250 aa15.39■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa15.39■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 CLEC19AQ6UXS0 136 aa15.39■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 C10orf126Q8N4M7 172 aa15.39■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 ANKRD29Q8N6D5 301 aa15.39■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 Q8N9W7 124 aa15.39■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa15.39■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 C11orf86A6NJI1 115 aa15.38■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 CRYGDP07320 174 aa15.38■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 CFC1BP0CG36 223 aa15.38■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 CFC1P0CG37 223 aa15.38■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 ASIPP42127 132 aa15.38■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 C16orf92Q96LL3 132 aa15.38■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC140Q96MF4 163 aa15.38■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa15.38■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa15.38■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 LINC01548A6NM66 108 aa15.38■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHV3-30P01768 117 aa15.38■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa15.38■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 ZFAND6Q6FIF0 208 aa15.38■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa15.38■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 TRAV21A0A0B4J279 112 aa15.37■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 MINOS1Q5TGZ0 78 aa15.37■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa15.37■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 MED14OSP0DP75 135 aa15.37■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa15.37■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 TIMD4Q96H15 378 aa15.37■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 SCGB1C2P0DMR2 95 aa15.36■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 C9orf139Q6ZV77 190 aa15.36■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 TEX29Q8N6K0 151 aa15.36■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 PRO1854Q9UHT4 67 aa15.36■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 U3KQE9 123 aa15.36■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 M0QXV9 152 aa15.35■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC25A29Q8N8R3 303 aa15.35■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 J3KRW8 73 aa15.35■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 PMVKQ15126 192 aa15.35■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 LINC00477Q96M19 166 aa15.35■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 KIR2DL4Q99706 377 aa15.34■□□□□ 0.05
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms