RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 RAB9AP51151 201 aa6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 EFNA4P52798 201 aa6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 HES1Q14469 280 aa6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.51□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.5□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 F8VRH5 84 aa6.5□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 LINC01560Q8TB33 94 aa6.5□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 HIST1H4GQ99525 98 aa6.5□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.5□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.5□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 SCGB2A1O75556 95 aa6.5□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 GAGE13Q4V321 117 aa6.5□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.5□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.5□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 H7C1H1 209 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 CD3EP07766 207 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 INSL3P51460 131 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 EBI3Q14213 229 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 KLK9Q2XQG4 91 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 MTURNQ8N3F0 131 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 M0R1W7 72 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 PRTN3P24158 256 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 Q6ZQT7 251 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.49□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 OR11H12B2RN74 326 aa6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 CKS1BP61024 79 aa6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF843Q8N446 348 aa6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 OR11H1Q8NG94 326 aa6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 OR11H2Q8NH07 326 aa6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 MRAP2Q96G30 205 aa6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC25A16P16260 332 aa6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 TOMM6Q96B49 74 aa6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.48□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 RNF223E7ERA6 249 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 C15orf32Q32M92 178 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC140Q96MF4 163 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 COX6B1P14854 86 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 UBE2D1P51668 147 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP5G2Q06055 141 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 PRR9Q5T870 116 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 Q8N9W7 124 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.47□□□□□ -1.37
UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 OOSP1A8MZH6 123 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 H3BVH4 76 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 LY6HO94772 140 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 CLEC3BP05452 202 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 FOXI1Q12951 378 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 RASL10AQ92737 203 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 C20orf78Q9BR46 151 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 APOMO95445 188 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 PF4V1P10720 104 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 BAALCQ8WXS3 180 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 CDIP1Q9H305 208 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 U3KQE9 123 aa6.46□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.45□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 NFE4Q86UQ8 179 aa6.45□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 LRBAP50851 2863 aa6.45□□□□□ -1.38
UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms