RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZQT7 251 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-201ENST00000284957 STPG4Q8N801 248 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-201ENST00000284957 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-201ENST00000284957 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.99□□□□□ -1.29
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RABGEF1-201ENST00000284957 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-201ENST00000284957 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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RABGEF1-201ENST00000284957 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 SERF1AO75920 110 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV3-20P01619 116 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 MT-ND6P03923 174 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-201ENST00000284957 COX19Q49B96 90 aa6.93□□□□□ -1.3
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