RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 TSPAN13O95857 204 aa8.31□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 IGKV3-20P01619 116 aa8.31□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 CD99P14209 185 aa8.31□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 KIR3DS1Q14943 382 aa8.31□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.31□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.31□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa8.3□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 OSTCQ9NRP0 149 aa8.3□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.3□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 P01737 135 aa8.3□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 CAMPP49913 170 aa8.3□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.3□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.3□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 GTSF1Q8WW33 167 aa8.3□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.3□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF580Q9UK33 172 aa8.3□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 HIGD1CA8MV81 97 aa8.29□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF688P0C7X2 276 aa8.29□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 FOXL1Q12952 345 aa8.29□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 COX19Q49B96 90 aa8.29□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 SPATA45Q537H7 98 aa8.29□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.29□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 NUP35Q8NFH5 326 aa8.29□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 PRR25Q96S07 402 aa8.29□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 NRN1Q9NPD7 142 aa8.29□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 SPRY2O43597 315 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 HILS1P60008 231 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM86BQ8N661 226 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 A0A087X0K7 114 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 TEX29Q8N6K0 151 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 MRAP2Q96G30 205 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1W2PS18 150 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 C2orf70A6NJV1 201 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 RAX2Q96IS3 184 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
GGPS1-201ENST00000282841 SH2D1AO60880 128 aa8.27□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 SNURFLB1AK76 121 aa8.27□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 SOCS3O14543 225 aa8.27□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 PSMG4Q5JS54 123 aa8.27□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 PRR9Q5T870 116 aa8.27□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 BTF3L4Q96K17 158 aa8.27□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.27□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.26□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM89A2RUT3 159 aa8.26□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 OR11H12B2RN74 326 aa8.26□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 LINC01619G3V211 115 aa8.26□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.26□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 RNF152Q8N8N0 203 aa8.26□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.26□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 OR11H2Q8NH07 326 aa8.26□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 RNF114Q9Y508 228 aa8.26□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.26□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 CT45A10P0DMU9 189 aa8.26□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.26□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 ORM1P02763 201 aa8.25□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP10-3P60369 221 aa8.25□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.25□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 DCANP1Q8TF63 244 aa8.25□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 COL6A5A8TX70 2615 aa8.25□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 F2Z2F3 143 aa8.25□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 IGLC3P0DOY3 106 aa8.25□□□□□ -1.09
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GGPS1-201ENST00000282841 Q6ZWC4 215 aa8.25□□□□□ -1.09
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GGPS1-201ENST00000282841 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.25□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 C11orf21Q9P2W6 132 aa8.25□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.25□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 NUPR1O60356 82 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF253O75346 499 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 TSPOP30536 169 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 K7EMT4 169 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 TAX1BP3O14907 124 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 B5MCH6 92 aa8.24□□□□□ -1.09
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