RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252211.6

ZKSCAN3-201, Transcript of zinc finger with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZKSCAN3, Length 4,725 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SLC25A20O43772 301 aa9.51□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.51□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ABCA12Q86UK0 2595 aa9.51□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 K7EMT4 169 aa9.51□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HLA-DMBP28068 263 aa9.51□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 VWC2Q2TAL6 325 aa9.51□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.51□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.51□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C17orf77Q96MU5 243 aa9.51□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GPHB5Q86YW7 130 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C2orf70A6NJV1 201 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TEX22C9J3V5 150 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 INAFM1C9JVW0 142 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 APRG1Q8IVJ8 170 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C11orf52Q96A22 123 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CENPFP49454 3210 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PCNX3Q9H6A9 2034 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CGB3P0DN86 165 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CGB7P0DN87 165 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DYNAPQ8N1N2 210 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ODF3BA8MYP8 253 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PAX4O43316 350 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MEGF9Q9H1U4 602 aa9.5□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 BUB3O43684 328 aa9.49□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.49□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.49□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.49□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.49□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.49□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RBAKDNA6NC62 111 aa9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 M0R2P5 195 aa9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PYY3Q5JQD4 70 aa9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C16orf54Q6UWD8 224 aa9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 INSL3P51460 131 aa9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM243Q9BU79 118 aa9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 I3L3M4 83 aa9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LRRK2Q5S007 2527 aa9.48□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C9JQL5 133 aa9.47□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q6YL49 198 aa9.47□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RNF152Q8N8N0 203 aa9.47□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C5orf30Q96GV9 206 aa9.47□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 JPT2Q9H910 190 aa9.47□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM238C9JI98 176 aa9.47□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PLP1P60201 277 aa9.47□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RHOHQ15669 191 aa9.47□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.46□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 RMI2Q96E14 147 aa9.46□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.46□□□□□ -0.89
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 U3KQE9 123 aa9.46□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A8MWP6 167 aa9.46□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.46□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa9.46□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa9.45□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.45□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.45□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa9.45□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.45□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGHG4P01861 327 aa9.45□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.45□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGLV2-14P01704 120 aa9.45□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.45□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 E7EUB6 86 aa9.44□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 DLEU1O43261 78 aa9.44□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.44□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.44□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LTAP01374 205 aa9.44□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GAGE6Q13070 117 aa9.44□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 EREGO14944 169 aa9.44□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ADCYAP1P18509 176 aa9.44□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.44□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 V9GYV3 84 aa9.44□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 GNRH2O43555 120 aa9.44□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 PATE2Q6UY27 113 aa9.44□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A096LPF7 62 aa9.43□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.43□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CDSNQ15517 529 aa9.43□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.43□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 Q8N8P6 123 aa9.43□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 CST9LQ9H4G1 147 aa9.43□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 LY6G6DO95868 133 aa9.43□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.43□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.43□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 A0A0J9YY99 117 aa9.43□□□□□ -0.9
ZKSCAN3-201ENST00000252211 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms