RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 SERF1AO75920 110 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 LINC00310P59036 64 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 BAGE3Q86Y29 109 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 C4orf3Q8WVX3 66 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 ZFP30Q9Y2G7 519 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF580Q9UK33 172 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 RNF24Q9Y225 148 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 A0A087WWL8 130 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 PPP1R2P9O14990 202 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 CRISP2P16562 243 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 Q9UF83 564 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 DNHD1Q96M86 4753 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 PAFAH1B2P68402 229 aa4.88□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 EMP1P54849 157 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 PRELID1Q9Y255 219 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 A0A087X0K7 114 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1B0GUT8 65 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 DEFB4AO15263 64 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 APCSP02743 223 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 S100A2P29034 98 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 DEFB125Q8N687 156 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 A0A0J9YX75 114 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 RNF152Q8N8N0 203 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 LY96Q9Y6Y9 160 aa4.87□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 K7EMT4 169 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 ATOH7Q8N100 152 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM86BQ8N661 226 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 HBBP68871 147 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 A8MWP6 167 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 D6R8Y8 96 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 IGLL1P15814 213 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 SAMD10Q9BYL1 202 aa4.86□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 AMBPP02760 352 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 AZU1P20160 251 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 TDRG1Q3Y452 100 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 PYY3Q5JQD4 70 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 Q8N1Y9 231 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM208Q9BTX3 173 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 C12orf57Q99622 126 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 MGPP08493 103 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 PEMTQ9UBM1 199 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 TYMSP04818 313 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 HOXA5P20719 270 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 ID1P41134 155 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.85□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 BRI3O95415 125 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV3-53P01767 116 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 AMTP48728 403 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 NIT2Q9NQR4 276 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1B0GXF2 115 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 H3BMM0 161 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 CRXO43186 299 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 FHL3Q13643 280 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 P0DMU3 169 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 FAM231AP0DMU4 169 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 FAM231CP0DMU5 169 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 BMI1P35226 326 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 REC114Q7Z4M0 266 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.84□□□□□ -1.63
CNIH1-201ENST00000216416 CBY3A6NI87 242 aa4.84□□□□□ -1.64
CNIH1-201ENST00000216416 LGALS9O00182 355 aa4.84□□□□□ -1.64
CNIH1-201ENST00000216416 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
CNIH1-201ENST00000216416 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
CNIH1-201ENST00000216416 PRO1933Q9H354 126 aa4.84□□□□□ -1.64
CNIH1-201ENST00000216416 F5H697 171 aa4.83□□□□□ -1.64
CNIH1-201ENST00000216416 NPYP01303 97 aa4.83□□□□□ -1.64
CNIH1-201ENST00000216416 CDKN1BP46527 198 aa4.83□□□□□ -1.64
CNIH1-201ENST00000216416 MEOX2P50222 304 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms