RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028769.12

Ptpra-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpra, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Smim9Q3V0X1 137 aa14.71□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr715Q8VG49 315 aa14.71□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rab31Q921E2 194 aa14.71□□□□□ -0.05
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr912A0A1L1SSS5 310 aa14.71□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm21882J3QN86 361 aa14.71□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 GzmfP08883 248 aa14.71□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Atp5g2P56383 146 aa14.71□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ctdsp1P58466 261 aa14.71□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vma21Q78T54 101 aa14.71□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr577Q8VH11 312 aa14.71□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cd200r1Q9ES57 326 aa14.71□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ncoa6Q9JL19 2067 aa14.71□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ucp1P12242 307 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tpt1P63028 172 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm10334Q792Y8 246 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Dppa1Q810Y7 116 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr513Q8VFZ3 309 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rnf115Q9D0C1 305 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fancd2osQ9D4K4 178 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r171Q9EPS6 316 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tnfsf11O35235 316 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 MiaQ61865 130 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 HaaoQ78JT3 286 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tbx19Q99ME7 446 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Opn3Q9WUK7 400 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gpr132Q9Z282 382 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm20773A0A0A6YXW2 232 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm20807A0A0A6YXX7 232 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Igkv6-15A0A140T8M5 115 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 A0A286YDM5 308 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm5129F6YHA9 99 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm20873J3QMQ9 232 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm20795J3QP49 232 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Il3raP26952 396 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rpl31P62900 125 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm21440Q3TTD8 232 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc37a1Q8R070 531 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr770Q8VGC2 311 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Pear1Q8VIK5 1034 aa14.7□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Psg17Q62056 475 aa14.69□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Aadacl4Q8BM81 407 aa14.69□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Atp6v1fQ9D1K2 119 aa14.69□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Eny2Q9JIX0 101 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm42420A0A0J9YUQ2 99 aa14.69□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 A630076J17RikJ3QQ32 107 aa14.69□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm10803Q3TZS6 135 aa14.69□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Wdr83osQ6ZWX0 106 aa14.69□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr153Q7TR48 307 aa14.69□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr924Q7TRB8 308 aa14.69□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1448Q8VFX1 314 aa14.69□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Scgb1b27Q91WB5 92 aa14.69□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Prss30Q9QYZ9 310 aa14.69□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Trav4-2A0A075B638 110 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Frrs1lB1AXV0 293 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Bet1lO35153 111 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cd59aO55186 123 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tnfrsf17O88472 185 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 G430049J08RikQ3TL09 166 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Kcnip4Q6PHZ8 250 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fam174bQ8K064 153 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 B3gnt9Q8VI16 399 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tm2d1Q99MB3 208 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tmem126bQ9D1R1 230 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Nubp1Q9R060 320 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Bcl2l10Q9Z0F3 191 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sptbn4E9PX29 2561 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Trav8n-2A0A075B633 112 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Degs1O09005 323 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr530Q8VFE8 307 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 AmtnQ9D3J8 213 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mettl9Q9EPL4 318 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Crybb1Q9WVJ5 250 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Wnt5bP22726 359 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 A230072I06RikQ3UUJ8 172 aa14.68□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm3045A0A1D5RMA1 209 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm20422E9PUR3 255 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp708F8VPP0 541 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r78K7N608 313 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cd81P35762 236 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cnn1Q08091 297 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 2810408A11RikQ6NSU2 435 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1383Q7TQT2 311 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Trib1Q8K4K4 372 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Scp2d1Q9DAH1 156 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Esp6A8R0U0 136 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 F2rl2O08675 369 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mef2bO55087 349 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gpm6bP35803 328 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sf3a2Q62203 475 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Kazald1Q8BJ66 313 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Lypd6Q8BPP5 171 aa14.67□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm14325A2AW67 498 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm5218F6YH22 154 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sfrp2P97299 295 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 SnrpcQ62241 159 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gpa33Q9JKA5 319 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 DspE9Q557 2883 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Col6a4A2AX52 2309 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Pef1Q8BFY6 275 aa14.66□□□□□ -0.06
Ptpra-201ENSMUST00000028769 CckarO08786 436 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.3 ms