RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636154.2

RAB34-223, Transcript of RAB34, member RAS oncogene family, human

TSL 2 BASIC

Gene RAB34, Length 730 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB34-223	ENST00000636154	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	C18orf15	Q96N68	181 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	TCL1A	P56279	114 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	PRR9	Q5T870	116 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154		Q6AWC8	147 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	HMSD	A8MTL9	139 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	ZNF415	Q09FC8	603 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RAB34-223	ENST00000636154	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154		A0A1W2PRE2	83 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	GAGE12B	A1L429	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	GAGE7	O76087	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	GAGE12F	P0CL80	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	GAGE12G	P0CL81	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	GAGE12I	P0CL82	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		11.27	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154		A0A0D9SG52	128 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154		H3BNG1	76 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	TCRA	P04437	139 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	ATG101	Q9BSB4	218 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	TREM1	Q9NP99	234 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	SPINK4	O60575	86 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	TDRG1	Q3Y452	100 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154		Q6ZTI0	123 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		11.25	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	GGTLC3	B5MD39	225 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	SMLR1	H3BR10	107 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	NUDT3	O95989	172 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	CCL18	P55774	89 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	GNG5	P63218	68 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	OR5I1	Q13606	314 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	ZFP69	Q49AA0	526 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	STOML3	Q8TAV4	291 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	EPDR1	Q9UM22	224 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		11.24	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	UMAD1	C9J7I0	102 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	MUC21	Q5SSG8	566 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	SSX7	Q7RTT5	188 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	KCNS1	Q96KK3	526 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	SPX	Q9BT56	116 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	BCL2L11	O43521	198 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	SEC11B	P0C7V7	166 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	PPT1	P50897	306 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	SLA	Q13239	276 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	NAGK	Q9UJ70	344 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	PSG8	Q9UQ74	426 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB34-223	ENST00000636154		F6UZH7	168 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB34-223	ENST00000636154	IFNA7	P01567	189 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB34-223	ENST00000636154	HOXA5	P20719	270 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB34-223	ENST00000636154	SMUG1	Q53HV7	270 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB34-223	ENST00000636154	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB34-223	ENST00000636154		Q6ZQT7	251 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB34-223	ENST00000636154	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB34-223	ENST00000636154	TVP23C	Q96ET8	276 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB34-223	ENST00000636154	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB34-223	ENST00000636154	MUC4	Q99102	2169 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB34-223	ENST00000636154	FAM74A7	A6NL05	159 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB34-223	ENST00000636154	PFDN1	O60925	122 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB34-223	ENST00000636154	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RAB34-223	ENST00000636154	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RAB34-223	ENST00000636154	RASL10A	Q92737	203 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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