RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 VWC2Q2TAL6 325 aa12.87□□□□□ -0.35
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CLN3-241ENST00000635861 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CLN3-241ENST00000635861 LINC00588Q9Y4M8 146 aa12.87□□□□□ -0.35
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CLN3-241ENST00000635861 SLC17A3O00476 420 aa12.86□□□□□ -0.35
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CLN3-241ENST00000635861 MIC13Q5XKP0 118 aa12.82□□□□□ -0.36
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CLN3-241ENST00000635861 TMEM14CQ9P0S9 112 aa12.82□□□□□ -0.36
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CLN3-241ENST00000635861 KHDC3LQ587J8 217 aa12.79□□□□□ -0.36
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CLN3-241ENST00000635861 C7orf71A4D174 169 aa12.78□□□□□ -0.36
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CLN3-241ENST00000635861 RAB5AP20339 215 aa12.78□□□□□ -0.36
CLN3-241ENST00000635861 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa12.78□□□□□ -0.36
CLN3-241ENST00000635861 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
CLN3-241ENST00000635861 J3KRW8 73 aa12.77□□□□□ -0.37
CLN3-241ENST00000635861 RPL35P42766 123 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
CLN3-241ENST00000635861 SERF2P84101 59 aa12.77□□□□□ -0.37
CLN3-241ENST00000635861 FAM213BQ8TBF2 198 aa12.77□□□□□ -0.37
CLN3-241ENST00000635861 SCGB1C1Q8TD33 95 aa12.77□□□□□ -0.37
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