RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	CCL19	Q99731	98 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	SNAI2	O43623	268 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	ST20	Q9HBF5	79 aa		10.06	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152		A0A087X0K7	114 aa		10.05	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV3-11	P01762	117 aa		10.05	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		10.05	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		10.05	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		10.05	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	POLQ	O75417	2590 aa		10.05	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		10.05	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		10.05	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		10.05	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	MPV17L2	Q567V2	206 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	LINC01545	Q5VT33	79 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	COX11	Q9Y6N1	276 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152		U3KQK5	164 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	PPBP	P02775	128 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	EVI2A	P22794	236 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	ARL3	P36405	182 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	ATP5J2	P56134	94 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	C16orf92	Q96LL3	132 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	DEFB1	P60022	68 aa		10.04	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152		H3BUX3	64 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	BLCAP	P62952	87 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	FOXE3	Q13461	319 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM238	C9JI98	176 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	NUDT3	O95989	172 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	KLK9	Q2XQG4	91 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152		Q6ZS46	218 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	RNF185	Q96GF1	192 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		10.03	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	NRGN	Q92686	78 aa		10.02	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	C18orf15	Q96N68	181 aa		10.02	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	KLK15	Q9H2R5	256 aa		10.02	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		10.02	□□□□□ -0.8
BRF1-222	ENST00000635152	IGF1	P05019	195 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	LINC01559	Q495D7	138 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	ZAN	Q9Y493	2812 aa		10.02	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	RBAKDN	A6NC62	111 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	HBD	P02042	147 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	CACNG7	P62955	275 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	CSTL1	Q9H114	145 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	PF4V1	P10720	104 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	SVIP	Q8NHG7	77 aa		10.01	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	FAM223B	A6NKX1	122 aa		10	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	SPRY2	O43597	315 aa		10	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		10	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	C20orf173	Q96LM9	149 aa		10	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		10	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152		U3KQE9	123 aa		10	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		10	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	VAMP3	Q15836	100 aa		10	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		10	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		10	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		10	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	CNFN	Q9BYD5	112 aa		10	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		10	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	TNFRSF6B	O95407	300 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	PRR9	Q5T870	116 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	GLMP	Q8WWB7	406 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	CST9L	Q9H4G1	147 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	LRRK2	Q5S007	2527 aa		9.99	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	CIDEA	O60543	219 aa		9.98	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	AVP	P01185	164 aa		9.98	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		9.98	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152		H3BVH4	76 aa		9.98	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	MSMB	P08118	114 aa		9.98	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	SRD5A1	P18405	259 aa		9.98	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	LEP	P41159	167 aa		9.98	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		9.98	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		9.98	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	CREBBP	Q92793	2442 aa		9.97	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		9.97	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152		F6UB75	175 aa		9.97	□□□□□ -0.81
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		9.97	□□□□□ -0.81

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