RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	GAPT	Q8N292	157 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	STPG3	Q8N7X2	389 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	RITA1	Q96K30	269 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	HIGD1B	Q9P298	99 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0G2JRQ6	117 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	C17orf98	A8MV24	154 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV1-16	P04430	117 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	DLX6	P56179	175 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC35B1	P78383	322 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00596	Q86U02	117 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	S1PR3	Q99500	378 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	RAB9B	Q9NP90	201 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	VWF	P04275	2813 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495		F8WDY8	70 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	MFAP4	P55083	255 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	LOXL3	P58215	753 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	RTL8B	Q17RB0	113 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	TTC32	Q5I0X7	151 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR31	Q5SQ13	230 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	CACNG5	Q9UF02	275 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		5.68	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	DNHD1	Q96M86	4753 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	MOS	P00540	346 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	GAGE2B	Q13066	116 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	ECSCR	Q19T08	205 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	GAGE2E	Q4V326	116 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXL15	Q9H469	300 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLL5	B9A064	214 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	SPINK9	Q5DT21	86 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	CENPW	Q5EE01	88 aa		5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC01548	A6NM66	108 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	ACTL6B	O94805	426 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM106CP	P0CH98	169 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FHL3	Q13643	280 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	DUX3	Q96PT4	197 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	SPANXC	Q9NY87	97 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	MPDU1	O75352	247 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	MFAP2	P55001	183 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	HILS1	P60008	231 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	C18orf15	Q96N68	181 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495		S4R3C0	116 aa		5.66	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFRSF6B	O95407	300 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV1-47	P01700	117 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	GCSH	P23434	173 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	FXYD3	Q14802	87 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZRM9	215 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	MRAP	Q8TCY5	172 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	TNC	P24821	2201 aa		5.65	□□□□□ -1.5
LETMD1-238	ENST00000623495	MYOD1	P15172	320 aa		5.65	□□□□□ -1.51
LETMD1-238	ENST00000623495	ASIP	P42127	132 aa		5.65	□□□□□ -1.51
LETMD1-238	ENST00000623495	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		5.65	□□□□□ -1.51
LETMD1-238	ENST00000623495	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		5.65	□□□□□ -1.51
LETMD1-238	ENST00000623495	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		5.65	□□□□□ -1.51
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6YL49	198 aa		5.65	□□□□□ -1.51
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		5.65	□□□□□ -1.51
LETMD1-238	ENST00000623495	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		5.65	□□□□□ -1.51
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		5.65	□□□□□ -1.51
LETMD1-238	ENST00000623495	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		5.64	□□□□□ -1.51
LETMD1-238	ENST00000623495	SNCG	O76070	127 aa		5.64	□□□□□ -1.51
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF688	P0C7X2	276 aa		5.64	□□□□□ -1.51

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