RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622079.1

LINC00869-209, long intergenic non-protein coding RNA 869, human

TSL 1 (best)

Gene LINC00869, Length 1,064 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00869-209	ENST00000622079	IGHV3-48	P01763	117 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	CD3D	P04234	171 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	GYPB	P06028	91 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	PTHLH	P12272	177 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	IL3RA	P26951	378 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	P2RX1	P51575	399 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	CDK5R1	Q15078	307 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	MPV17L	Q2QL34	196 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	BRK1	Q8WUW1	75 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	C2orf50	Q96LR7	162 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	C20orf78	Q9BR46	151 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	PAXX	Q9BUH6	204 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	ACACA	Q13085	2346 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	VWA8	A3KMH1	1905 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	ZNF727	A8MUV8	499 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	C8orf87	E5RJ46	101 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079		H0Y9J4	135 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	LGALS9	O00182	355 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	RTL8C	O15255	209 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	CACNG7	P62955	275 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	FOXF1	Q12946	379 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	KIAA0087	Q14695	138 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	ETDB	Q3ZM63	59 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	CENPW	Q5EE01	88 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	RNF182	Q8N6D2	247 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079		Q8N976	141 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	DEFB124	Q8NES8	71 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	LRRC29	Q8WV35	223 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	KLK6	Q92876	244 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	OR2A5	Q96R48	311 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	HES2	Q9Y543	173 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LINC00869-209	ENST00000622079	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	CACNA1E	Q15878	2313 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079		A0A0J9YW62	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079		A0A1B0GXF2	115 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	PGP	A6NDG6	321 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	OOSP1	A8MZH6	123 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079		C9JQL5	133 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079		H3BT86	120 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079		J3QKU1	62 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	ATOX1	O00244	68 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	GNGT2	O14610	69 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	UBE2L6	O14933	153 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	NDUFB3	O43676	98 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	CST7	O76096	145 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	HLA-DRB4	P13762	266 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	CBLN1	P23435	193 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	PSMB2	P49721	201 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	NPC2	P61916	151 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	ERCC8	Q13216	396 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079		Q1RN00	199 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	TEN1	Q86WV5	123 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	LINC00311	Q8N616	119 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	MGST2	Q99735	147 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	CKLF	Q9UBR5	152 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	FBN2	P35556	2912 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	MYLK	Q15746	1914 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079		A8MWL6	223 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	SMIM13	P0DJ93	91 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LINC00869-209	ENST00000622079	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		3.57	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms