RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617444.4

SLC35E2B-205, Transcript of solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC35E2B, Length 6,283 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM120AOSQ5T036 256 aa10.86□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa10.86□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 H3BMG7 143 aa10.86□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 Q6ZWC4 215 aa10.86□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 PSME4Q14997 1843 aa10.86□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP10.86□□□□□ -0.673e-9■■■■■ 28.2
SLC35E2B-205ENST00000617444 V9GYV3 84 aa10.85□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 XCL1P47992 114 aa10.85□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 TIMM17AQ99595 171 aa10.85□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 NPYP01303 97 aa10.85□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 CFPP27918 469 aa10.85□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 NPSP0C0P6 89 aa10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 C9orf66Q5T8R8 295 aa10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 TMEM14CQ9P0S9 112 aa10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCL24O00175 119 aa10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 C5orf47Q569G3 176 aa10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 CFHR4Q92496 578 aa10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF407Q9C0G0 2248 aa10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 H3BRN7 92 aa10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 TIRAPP58753 221 aa10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 TEX36Q5VZQ5 186 aa10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 PYGO2Q9BRQ0 406 aa10.84□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa10.83□□□□□ -0.67
SLC35E2B-205ENST00000617444 F8W735 103 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 C15orf53Q8NAA6 179 aa10.83□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 C20orf78Q9BR46 151 aa10.83□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 BRWD3Q6RI45 1802 aa10.83□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCL18P55774 89 aa10.83□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF503Q96F45 646 aa10.83□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 SPANXCQ9NY87 97 aa10.83□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa10.83□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 RS1O15537 224 aa10.83□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 COL4A1P02462 1669 aa10.83□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 DEFB136Q30KP8 78 aa10.83□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 AMTNQ6UX39 209 aa10.83□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 K7ERJ3 54 aa10.82□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 PIFOQ8TCI5 191 aa10.82□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 C1orf43Q9BWL3 253 aa10.82□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 SHISA9B4DS77 424 aa10.82□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 DEFB112Q30KQ8 113 aa10.82□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 WDR90Q96KV7 1748 aa10.82□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 PKIGQ9Y2B9 76 aa10.82□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 DOCK11Q5JSL3 2073 aa10.82□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGHV3-30P01768 117 aa10.82□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGHV3-33P01772 117 aa10.82□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.82□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.82□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.82□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 BUB3O43684 328 aa10.81□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 SIVA1O15304 175 aa10.81□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 DEFB113Q30KQ7 82 aa10.81□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 Q8TCH9 128 aa10.81□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGHV4-59P01825 116 aa10.81□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 C12orf74Q32Q52 190 aa10.81□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa10.81□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa10.81□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF134P52741 427 aa10.81□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 ORMDL1Q9P0S3 153 aa10.81□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 CFC1BP0CG36 223 aa10.8□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 CFC1P0CG37 223 aa10.8□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 BOD1L2Q8IYS8 172 aa10.8□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa10.8□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 NDUFS7O75251 213 aa10.8□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF726P1Q15940 193 aa10.8□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 RHOHQ15669 191 aa10.8□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 BAALC-AS2P0C853 105 aa10.8□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 GP9P14770 177 aa10.8□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 K7EM74 188 aa10.8□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 WT1-ASQ06250 92 aa10.8□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 VOPP1Q96AW1 172 aa10.79□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 DOCK3Q8IZD9 2030 aa10.79□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 ELANEP08246 267 aa10.79□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 VPREB3Q9UKI3 123 aa10.79□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa10.79□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa10.79□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 WIPF3A6NGB9 483 aa10.79□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 DKK2Q9UBU2 259 aa10.79□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10.79□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 LINC00311Q8N616 119 aa10.79□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 LOXP28300 417 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 APRG1Q8IVJ8 170 aa10.78□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 IGHV2-70P01814 119 aa10.78□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 U3KQE9 123 aa10.78□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 WISP1O95388 367 aa10.78□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 C17orf58Q2M2W7 97 aa10.78□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF493Q6ZR52 646 aa10.78□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 TET1Q8NFU7 2136 aa10.78□□□□□ -0.68
SLC35E2B-205ENST00000617444 Q9H8V8 135 aa10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms