RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609752.1

LINC00484-208, long intergenic non-protein coding RNA 484, human

TSL 4 BASIC

Gene LINC00484, Length 591 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00484-208	ENST00000609752	GALM	Q96C23	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	LINC01619	G3V211	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752		J3KRW8	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	TNFSF12	O43508	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	SYNGR1	O43759	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	IGKV3-15	P01624	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	MFAP2	P55001	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	MGST2	Q99735	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	ASCL2	Q99929	193 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	THYN1	Q9P016	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752		A0A1W2PRD5	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752		A0A1W2PRF3	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752		A0A1W2PRM7	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752		A8MWL6	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752		E9PLD3	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752		H3BMG7	143 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	CCL2	P13500	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	EDDM3B	P56851	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	ERVK11-1	P61568	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	SPX	Q9BT56	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	EFNA2	O43921	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	LHB	P01229	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	BCL3	P20749	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	CCL8	P80075	99 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	TWIST1	Q15672	202 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752		Q6Q795	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	PIGC	Q92535	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	COQ2	Q96H96	371 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752		M0QXV9	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	G6PC	P35575	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	GLRX	P35754	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	ARL3	P36405	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	CARD17	Q5XLA6	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752		Q6AWC8	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	HIGD1C	A8MV81	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	CLEC3B	P05452	202 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	GNG3	P63215	75 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	FXYD3	Q14802	87 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC00484-208	ENST00000609752	PSG5	Q15238	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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