RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608107.1

ITGB5-211, Transcript of integrin subunit beta 5, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB5, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5-211ENST00000608107 CENPWQ5EE01 88 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 BAGE2Q86Y30 109 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 PARLQ9H300 379 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.46□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 C7orf71A4D174 169 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 UBE2CO00762 179 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 CRIP1P50238 77 aa7.45□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 TAS2R60P59551 318 aa7.45□□□□□ -1.22
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ITGB5-211ENST00000608107 B9D2Q9BPU9 175 aa7.45□□□□□ -1.22
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ITGB5-211ENST00000608107 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.44□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 MLST8Q9BVC4 326 aa7.44□□□□□ -1.22
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ITGB5-211ENST00000608107 INSP01308 110 aa7.43□□□□□ -1.22
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ITGB5-211ENST00000608107 OR11H2Q8NH07 326 aa7.43□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 OCC1Q8TAD7 63 aa7.43□□□□□ -1.22
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ITGB5-211ENST00000608107 SFTA3P0C7M3 94 aa7.42□□□□□ -1.22
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ITGB5-211ENST00000608107 FBN3Q75N90 2809 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 C9JCJ5 164 aa7.41□□□□□ -1.22
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ITGB5-211ENST00000608107 SPATA25Q9BR10 227 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 NAGKQ9UJ70 344 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.41□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 COL7A1Q02388 2944 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 TMEM218A2RU14 115 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 H7BYZ3 331 aa7.4□□□□□ -1.22
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ITGB5-211ENST00000608107 GNRH2O43555 120 aa7.4□□□□□ -1.22
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ITGB5-211ENST00000608107 UQCC3Q6UW78 93 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 ZNF575Q86XF7 245 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.4□□□□□ -1.22
ITGB5-211ENST00000608107 MUC4Q99102 2169 aa7.4□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa7.39□□□□□ -1.23
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ITGB5-211ENST00000608107 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.39□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.39□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 LINC01551Q86U37 167 aa7.39□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 Q8NAQ8 132 aa7.39□□□□□ -1.23
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ITGB5-211ENST00000608107 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.39□□□□□ -1.23
ITGB5-211ENST00000608107 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa7.38□□□□□ -1.23
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