RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
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RNU6-87P-201ENST00000607561 A6NN06 94 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-87P-201ENST00000607561 NCR3O14931 201 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-87P-201ENST00000607561 UQCRQO14949 82 aa0.42□□□□□ -2.34
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RNU6-87P-201ENST00000607561 CCSMST1Q4G0I0 132 aa0.42□□□□□ -2.34
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RNU6-87P-201ENST00000607561 WFDC10AQ9H1F0 79 aa0.42□□□□□ -2.34
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RNU6-87P-201ENST00000607561 FHAD1B1AJZ9 1412 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-87P-201ENST00000607561 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-87P-201ENST00000607561 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa0.41□□□□□ -2.34
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RNU6-87P-201ENST00000607561 C9JAW5 83 aa0.41□□□□□ -2.34
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RNU6-87P-201ENST00000607561 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa0.41□□□□□ -2.34
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RNU6-87P-201ENST00000607561 BLCAPP62952 87 aa0.41□□□□□ -2.34
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RNU6-87P-201ENST00000607561 OTOSQ8NHW6 89 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPANXCQ9NY87 97 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-87P-201ENST00000607561 HIGD1AQ9Y241 93 aa0.41□□□□□ -2.34
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RNU6-87P-201ENST00000607561 PLXNA2O75051 1894 aa0.41□□□□□ -2.34
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RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM189A5PLL7 270 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF727A8MUV8 499 aa0.4□□□□□ -2.35
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RNU6-87P-201ENST00000607561 ADGRB1O14514 1584 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-87P-201ENST00000607561 PTPRMP28827 1452 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-87P-201ENST00000607561 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa0.38□□□□□ -2.35
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