RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600026.5

LTBP4-227, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 3

Gene LTBP4, Length 723 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-227	ENST00000600026	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		16.06	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	SPATA25	Q9BR10	227 aa		16.06	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		16.06	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	RETN	Q9HD89	108 aa		16.06	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026		C9JCJ5	164 aa		16.05	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026		M0R2Z0	102 aa		16.05	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	UBE2C	O00762	179 aa		16.05	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	16.05	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	GPX1	P07203	203 aa		16.05	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	FXYD7	P58549	80 aa		16.05	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026		J3KRW8	73 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	SMUG1	Q53HV7	270 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	TVP23C	Q96ET8	276 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	SMIM12	Q96EX1	92 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	ZMAT4	Q9H898	229 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	DEFB135	Q30KP9	77 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	C8orf49	Q96NF6	230 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM218	A2RU14	115 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	KLLN	B2CW77	178 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026		Q6ZWC4	215 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	XCL2	Q9UBD3	114 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LTBP4-227	ENST00000600026	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		16.01	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	INS	P01308	110 aa		16.01	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		16.01	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		16.01	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		16.01	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	MLST8	Q9BVC4	326 aa		16.01	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	BIN3	Q9NQY0	253 aa		16.01	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	NAT8	Q9UHE5	227 aa		16.01	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		16.01	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		16	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	C7orf71	A4D174	169 aa		16	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	GCG	P01275	180 aa		16	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		16	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	RCHY1	Q96PM5	261 aa		16	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		16	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026		F8W036	122 aa		15.99	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	BTN1A1	Q13410	526 aa		15.99	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		15.99	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		15.99	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		15.99	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		15.99	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		15.98	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	15.98	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	IGLV2-8	P01709	118 aa		15.98	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	KIR3DS1	Q14943	382 aa		15.98	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	PRR9	Q5T870	116 aa		15.98	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	OCC1	Q8TAD7	63 aa		15.98	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	RNF183	Q96D59	192 aa		15.98	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		15.98	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	SPRY2	O43597	315 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026		Q6AWC8	147 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	PRR27	Q6MZM9	219 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	SEC11C	Q9BY50	192 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026		U3KQK5	164 aa		15.97	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	COL7A1	Q02388	2944 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		15.96	■□□□□ 0.15
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	LINC01551	Q86U37	167 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		15.95	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	ADIRF	Q15847	76 aa		15.94	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026		K7EN84	100 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	SH2D1A	O60880	128 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	ADCYAP1	P18509	176 aa		15.93	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026		H7BYZ3	331 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	CRIP1	P50238	77 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	OR5I1	Q13606	314 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	LINC01587	Q99440	93 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	TENM3	Q9P273	2699 aa		15.92	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	OR11H2	Q8NH07	326 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	NAGK	Q9UJ70	344 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
LTBP4-227	ENST00000600026	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LTBP4-227	ENST00000600026	ORM1	P02763	201 aa		15.89	■□□□□ 0.13

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