RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593048.5

CIRBP-241, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene CIRBP, Length 650 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-241ENST00000593048 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.51□□□□□ -0.57
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CIRBP-241ENST00000593048 FAM74A7A6NL05 159 aa11.5□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 A8MTW9 85 aa11.5□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 M0R2N4 97 aa11.5□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 M0R2Z0 102 aa11.5□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 OR7C2O60412 319 aa11.5□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 INSP01308 110 aa11.5□□□□□ -0.57
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CIRBP-241ENST00000593048 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.48□□□□□ -0.57
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CIRBP-241ENST00000593048 SDF2L1Q9HCN8 221 aa11.48□□□□□ -0.57
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CIRBP-241ENST00000593048 LINC01587Q99440 93 aa11.47□□□□□ -0.57
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CIRBP-241ENST00000593048 CTDSP1Q9GZU7 261 aa11.47□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 A0A087X0K7 114 aa11.46□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 C7orf77A4D0Y5 90 aa11.46□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 C9JCJ5 164 aa11.46□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 M0R036 132 aa11.46□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 CRXO43186 299 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
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CIRBP-241ENST00000593048 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.46□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.46□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 PARLQ9H300 379 aa11.46□□□□□ -0.57
CIRBP-241ENST00000593048 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.45□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 LYRM9A8MSI8 78 aa11.45□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 NBEAP1P0C6P0 100 aa11.45□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 HTN1P15515 57 aa11.45□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 TMEM88Q6PEY1 159 aa11.45□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 FXYD5Q96DB9 178 aa11.45□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 SMIM12Q96EX1 92 aa11.45□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 ZNF253O75346 499 aa11.44□□□□□ -0.58
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CIRBP-241ENST00000593048 DEFB130AP0DP74 79 aa11.44□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
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CIRBP-241ENST00000593048 SLC50A1Q9BRV3 221 aa11.44□□□□□ -0.58
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CIRBP-241ENST00000593048 RNF212Q495C1 297 aa11.43□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.43□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 C15orf54Q8N8G6 183 aa11.43□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 ANAPC16Q96DE5 110 aa11.43□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 RPS10P5Q9NQ39 176 aa11.43□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 RYR1P21817 5038 aa11.43□□□□□ -0.58
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CIRBP-241ENST00000593048 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.42□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 BTF3L4Q96K17 158 aa11.42□□□□□ -0.58
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CIRBP-241ENST00000593048 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.41□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa11.41□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 F5H768 121 aa11.41□□□□□ -0.58
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CIRBP-241ENST00000593048 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 MORN5Q5VZ52 161 aa11.41□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 C5orf17Q8NAS9 161 aa11.41□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.41□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 C16orf74Q96GX8 76 aa11.41□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 ATG101Q9BSB4 218 aa11.41□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 OTORQ9NRC9 128 aa11.41□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 H3BTX0 84 aa11.4□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 RTL8CO15255 209 aa11.4□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 SCO1O75880 301 aa11.4□□□□□ -0.58
CIRBP-241ENST00000593048 OR10J4P0C629 311 aa11.4□□□□□ -0.58
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