RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-210	ENST00000588340	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	HBE1	P02100	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	CDKN1B	P46527	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	FHIT	P49789	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	SULT1A2	P50226	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	RAB5C	P51148	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	VGLL1	Q99990	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340		M0R2Z0	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TCRA	P04437	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	KIR3DS1	Q14943	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	PRR9	Q5T870	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	PGP	A6NDG6	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	INS	P01308	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	PRM2	P04554	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340		P0DMU3	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	ZNF138	P52744	262 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340		Q6AWC8	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340		H7BYZ3	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	PFDN1	O60925	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	HTN3	P15516	51 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	AZU1	P20160	251 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	LEP	P41159	167 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TAS2R60	P59551	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	DAD1	P61803	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	ERCC8	Q13216	396 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	C7orf71	A4D174	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	CSN1S1	P47710	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	CCL20	P78556	96 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340		Q8TAT8	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
EFTUD2-210	ENST00000588340	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.5 ms