RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580081.1

CLTC-212, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 4

Gene CLTC, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-212ENST00000580081 A8MTW9 85 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 OR11H12B2RN74 326 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 HLA-DRB4P13762 266 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 LEPP41159 167 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 DEFB1P60022 68 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 ERVFC1-1P60608 527 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 OR5I1Q13606 314 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 PRR27Q6MZM9 219 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.52□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 SCO1O75880 301 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 CRISP2P16562 243 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 TSPOP30536 169 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 C8orf49Q96NF6 230 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 ASCL2Q99929 193 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 TUBA4BQ9H853 241 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 STAB1Q9NY15 2570 aa6.51□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 COL6A5A8TX70 2615 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 KNCNA6PVL3 124 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 H3BMM0 161 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 PAX4O43316 350 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 P01737 135 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 IGLL1P15814 213 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 CT83Q5H943 113 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 PRR31Q5SQ13 230 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 NUDT11Q96G61 164 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 IMMP2LQ96T52 175 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 V9GYV3 84 aa6.5□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 VWFP04275 2813 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 KLLNB2CW77 178 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 SH2D1AO60880 128 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 GPX1P07203 203 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 S100PP25815 95 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 CRIP1P50238 77 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 BTN1A1Q13410 526 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 AMTNQ6UX39 209 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 STHQ8IWL8 128 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 IL36BQ9NZH7 164 aa6.49□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 XKRY2A2RUG3 117 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 A8MWL6 223 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 IGKV3-20P01619 116 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 AMBPP02760 352 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 CD7P09564 240 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 CDKN1BP46527 198 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 ZNF124Q15973 351 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 Q6AWC8 147 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 TSKUQ8WUA8 353 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 BTF3L4Q96K17 158 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.47□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 C7orf71A4D174 169 aa6.47□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 TMEM189A5PLL7 270 aa6.47□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 FAM231BA6NCW3 169 aa6.47□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 PRR9Q5T870 116 aa6.47□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.47□□□□□ -1.37
CLTC-212ENST00000580081 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-212ENST00000580081 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLTC-212ENST00000580081 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLTC-212ENST00000580081 J3KRW8 73 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-212ENST00000580081 M0R2Z0 102 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-212ENST00000580081 ORM1P02763 201 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-212ENST00000580081 CXCL1P09341 107 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-212ENST00000580081 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLTC-212ENST00000580081 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms