RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.94□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 TAAR5O14804 337 aa11.94□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 NMBP08949 121 aa11.94□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa11.94□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 GAGE12BA1L429 117 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 RBAKDNA6NC62 111 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 GAGE7O76087 117 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 GPX1P07203 203 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 GAGE12FP0CL80 117 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 GAGE12GP0CL81 117 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 GAGE12IP0CL82 117 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 HOXA5P20719 270 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF138P52744 262 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 HYLS1Q96M11 299 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 PYGO2Q9BRQ0 406 aa11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 HERC1Q15751 4861 aa11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 C7orf71A4D174 169 aa11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 RNF222A6NCQ9 220 aa11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 H3BNG1 76 aa11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARPC5O15511 151 aa11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 INAFM2P0DMQ5 153 aa11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC00315P59091 139 aa11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 OTORQ9NRC9 128 aa11.92□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 PGPA6NDG6 321 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 SNURFLB1AK76 121 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIR3DS1Q14943 382 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 VGLL1Q99990 258 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF492Q9P255 531 aa11.91□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.9□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 CXorf1O96002 111 aa11.9□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 CRISP2P16562 243 aa11.9□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 RAB24Q969Q5 203 aa11.9□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 SH3BGRL3Q9H299 93 aa11.9□□□□□ -0.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 KLLNB2CW77 178 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 DIRC3C9JPN6 131 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 STAG3L2P0CL84 134 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 STAG3L3P0CL85 134 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARL14EPLP0DKL9 152 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMEM167BQ9NRX6 74 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 LENEPQ9Y5L5 61 aa11.89□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 RGS13O14921 159 aa11.88□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 EREGO14944 169 aa11.88□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 BTN1A1Q13410 526 aa11.88□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa11.88□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 IQCF2Q8IXL9 164 aa11.88□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF680Q8NEM1 530 aa11.88□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPH3ALQ9UNE2 315 aa11.88□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMLR1H3BR10 107 aa11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 K7EQM0 130 aa11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 GCHFRP30047 84 aa11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 CD300CQ08708 224 aa11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 TMED6Q8WW62 240 aa11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 ARPC5LQ9BPX5 153 aa11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.87□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A096LPF7 62 aa11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 G3V3Q6 166 aa11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 SIVA1O15304 175 aa11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERVFC1-1P60608 527 aa11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF345Q14585 488 aa11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q6ZTI0 123 aa11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q8TAT8 98 aa11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 VSIG2Q96IQ7 327 aa11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 ST6GAL2Q96JF0 529 aa11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 TRGV2A0A075B6R0 118 aa11.85□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A0D9SG52 128 aa11.85□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 HMSDA8MTL9 139 aa11.85□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 XGP55808 180 aa11.85□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q5VSD8 79 aa11.85□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDPF1Q6NVV7 123 aa11.85□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.85□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 FRZBQ92765 325 aa11.85□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa11.84□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa11.84□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms