RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 KLK12Q9UKR0 248 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.17□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 C5orf51A6NDU8 294 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 M0R2P5 195 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 CTDSP2O14595 271 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 GOSR2O14653 212 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 PHOX2AO14813 284 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 ANXA3P12429 323 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 KRTAP10-8P60410 259 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 SRPXP78539 464 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 MZT2AQ6P582 158 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZQT7 251 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 ATP5SQ99766 215 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 PRR13Q9NZ81 148 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 PRELID1Q9Y255 219 aa6.16□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 A0A087WWC5 75 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 A0A087WX48 190 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 PGPA6NDG6 321 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 PRSS46E5RG02 174 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 H3BP45 60 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 RGS5O15539 181 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 HLA-DQA1P01909 254 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 IGLC2P0DOY2 106 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 TAS2R19P59542 299 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 Q0VG73 95 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 PATE2Q6UY27 113 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF546Q86UE3 836 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 S100ZQ8WXG8 99 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 RNF185Q96GF1 192 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.15□□□□□ -1.42
SMAD3-211ENST00000559460 DISC1C4P0D8 188 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 USP17L23D6RBM5 183 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 H3BQ15 152 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 PANO1I0J062 215 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 M0R3E3 92 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 AGPAT2O15120 278 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 SYNGR2O43760 224 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 CIDEAO60543 219 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF253O75346 499 aa6.14□□□□□ -1.43
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SMAD3-211ENST00000559460 CRPP02741 224 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 S100A5P33763 92 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 C4orf46Q504U0 113 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 PRR9Q5T870 116 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 GTSF1Q8WW33 167 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 EXTL2Q9UBQ6 330 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 NAGKQ9UJ70 344 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.14□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 A0A087WYN8 130 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 MCFD2Q8NI22 146 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.13□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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SMAD3-211ENST00000559460 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 NIT1Q86X76 327 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF492Q9P255 531 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 VAX2Q9UIW0 290 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 GPR132Q9UNW8 380 aa6.12□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 FAM231BA6NCW3 169 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE12JA6NER3 117 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 PRSS1P07477 247 aa6.11□□□□□ -1.43
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF138P52744 262 aa6.11□□□□□ -1.43
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