RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 HCP5Q6MZN7 132 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TSC2P49815 1807 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 DKK1O94907 266 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRB-210ENST00000551525 HTN1P15515 57 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRB-210ENST00000551525 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRB-210ENST00000551525 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRB-210ENST00000551525 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
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PTPRB-210ENST00000551525 DSCR8Q96T75 97 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRB-210ENST00000551525 KAAG1Q9UBP8 84 aa5.03□□□□□ -1.6
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PTPRB-210ENST00000551525 GREB1Q4ZG55 1949 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 J3QRE1 110 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRB-210ENST00000551525 SDK2Q58EX2 2172 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 COL8A2P25067 703 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRB-210ENST00000551525 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRB-210ENST00000551525 FXYD2P54710 66 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRB-210ENST00000551525 LINC01620Q4KN68 170 aa5.02□□□□□ -1.61
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PTPRB-210ENST00000551525 THAP8Q8NA92 274 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 AMELYQ99218 206 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 COL6A6A6NMZ7 2263 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 TECTAO75443 2155 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRB-210ENST00000551525 Q8NA96 180 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 GBF1Q92538 1859 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 D6R8Y8 96 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 INSL3P51460 131 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 SPINK9Q5DT21 86 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRB-210ENST00000551525 LINC00311Q8N616 119 aa5.01□□□□□ -1.61
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PTPRB-210ENST00000551525 BEAN1Q3B7T3 259 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 C9orf139Q6ZV77 190 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 BDP1A6H8Y1 2624 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 NBASA2RRP1 2371 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 PI4KAP42356 2102 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 CFC1BP0CG36 223 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 CFC1P0CG37 223 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF138P52744 262 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 CRYBA2P53672 197 aa5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRB-210ENST00000551525 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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