RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 TM2D2Q9BX73 214 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 ATP5G1P05496 136 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 K7EQD1 137 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 PLA2G5P39877 138 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 KNCNA6PVL3 124 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 IGHG2P01859 326 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2WQ96B02 151 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 AJUBAQ96IF1 538 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00205P59089 165 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2V1Q13404 147 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 F8W1H4 67 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 CRLF1O75462 422 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 ADCYAP1P18509 176 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 SIRPDQ9H106 197 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 hDV102S1A0JD36 115 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 SMKR1H3BMG3 65 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV4-59P01825 116 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 GP9P14770 177 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM126AQ9H061 195 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 HLA-DMBP28068 263 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 C9orf118A6NHY6 69 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-208ENST00000550358 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 A6NDX4 124 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 CCL25O15444 150 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 DLEU1O43261 78 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 CCL18P55774 89 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 Q8N9W7 124 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 UBL5Q9BZL1 73 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 K7EIM0 57 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 GAGE6Q13070 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 LYPD6Q86Y78 171 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 LGALS9O00182 355 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV1-47P01700 117 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 ACYP1P07311 99 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV2-23P01705 113 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 U3KQE9 123 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 J3QQQ9 107 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 CEND1Q8N111 149 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF524Q96C55 264 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00479Q96M42 142 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 C14orf177Q52M58 125 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 PRO3102Q9H379 93 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 COX11Q9Y6N1 276 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 C9JQL5 133 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 H0YGX0 51 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 PCP4P48539 62 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 NPYP01303 97 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 IGHG4P01861 327 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 MPV17L2Q567V2 206 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 DSCR8Q96T75 97 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 ODF3BA8MYP8 253 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 H7C423 109 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 BUB3O43684 328 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 CTSGP08311 255 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 CYYR1Q96J86 154 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0U1RRA0 63 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.61□□□□□ -1.35
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